Protein–RNA interactions for Protein: P28799

GRN, Granulins, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRNP28799 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRNP28799 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRNP28799 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRNP28799 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRNP28799 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRNP28799 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GRNP28799 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRNP28799 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRNP28799 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRNP28799 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRNP28799 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRNP28799 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRNP28799 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRNP28799 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GRNP28799 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRNP28799 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRNP28799 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRNP28799 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRNP28799 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRNP28799 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRNP28799 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRNP28799 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GRNP28799 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRNP28799 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRNP28799 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRNP28799 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRNP28799 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRNP28799 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRNP28799 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRNP28799 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRNP28799 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRNP28799 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GRNP28799 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRNP28799 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRNP28799 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRNP28799 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRNP28799 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRNP28799 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRNP28799 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GRNP28799 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRNP28799 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GRNP28799 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GRNP28799 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRNP28799 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRNP28799 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRNP28799 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRNP28799 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRNP28799 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRNP28799 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRNP28799 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRNP28799 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRNP28799 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRNP28799 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRNP28799 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRNP28799 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRNP28799 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRNP28799 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRNP28799 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRNP28799 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRNP28799 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRNP28799 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRNP28799 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRNP28799 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRNP28799 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRNP28799 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRNP28799 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRNP28799 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRNP28799 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRNP28799 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRNP28799 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRNP28799 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRNP28799 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRNP28799 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRNP28799 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRNP28799 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRNP28799 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRNP28799 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRNP28799 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRNP28799 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRNP28799 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRNP28799 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRNP28799 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GRNP28799 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRNP28799 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRNP28799 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRNP28799 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRNP28799 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRNP28799 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRNP28799 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRNP28799 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRNP28799 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRNP28799 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRNP28799 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRNP28799 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GRNP28799 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRNP28799 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRNP28799 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRNP28799 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRNP28799 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRNP28799 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms