Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXP28300 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXP28300 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LOXP28300 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LOXP28300 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LOXP28300 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LOXP28300 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LOXP28300 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LOXP28300 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LOXP28300 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LOXP28300 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LOXP28300 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LOXP28300 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LOXP28300 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LOXP28300 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LOXP28300 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LOXP28300 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LOXP28300 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LOXP28300 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LOXP28300 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LOXP28300 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LOXP28300 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LOXP28300 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LOXP28300 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LOXP28300 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LOXP28300 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LOXP28300 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LOXP28300 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LOXP28300 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LOXP28300 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LOXP28300 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LOXP28300 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LOXP28300 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LOXP28300 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LOXP28300 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LOXP28300 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LOXP28300 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LOXP28300 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LOXP28300 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LOXP28300 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LOXP28300 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LOXP28300 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LOXP28300 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LOXP28300 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LOXP28300 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LOXP28300 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LOXP28300 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LOXP28300 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LOXP28300 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LOXP28300 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LOXP28300 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LOXP28300 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LOXP28300 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LOXP28300 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LOXP28300 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LOXP28300 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LOXP28300 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LOXP28300 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LOXP28300 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LOXP28300 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LOXP28300 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LOXP28300 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LOXP28300 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LOXP28300 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LOXP28300 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LOXP28300 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LOXP28300 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LOXP28300 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LOXP28300 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LOXP28300 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LOXP28300 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LOXP28300 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LOXP28300 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LOXP28300 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LOXP28300 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LOXP28300 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LOXP28300 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LOXP28300 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LOXP28300 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LOXP28300 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LOXP28300 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LOXP28300 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LOXP28300 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LOXP28300 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LOXP28300 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LOXP28300 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LOXP28300 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LOXP28300 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LOXP28300 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LOXP28300 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LOXP28300 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LOXP28300 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LOXP28300 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LOXP28300 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LOXP28300 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LOXP28300 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LOXP28300 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LOXP28300 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LOXP28300 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LOXP28300 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms