Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAMP1P23763 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAMP1P23763 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAMP1P23763 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAMP1P23763 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAMP1P23763 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAMP1P23763 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VAMP1P23763 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VAMP1P23763 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VAMP1P23763 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAMP1P23763 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAMP1P23763 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VAMP1P23763 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAMP1P23763 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAMP1P23763 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAMP1P23763 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAMP1P23763 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAMP1P23763 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VAMP1P23763 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAMP1P23763 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAMP1P23763 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAMP1P23763 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAMP1P23763 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAMP1P23763 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAMP1P23763 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VAMP1P23763 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAMP1P23763 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAMP1P23763 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
VAMP1P23763 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAMP1P23763 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAMP1P23763 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VAMP1P23763 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VAMP1P23763 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAMP1P23763 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms