Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFSF4P23510 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF4P23510 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF4P23510 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF4P23510 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF4P23510 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF4P23510 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF4P23510 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF4P23510 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF4P23510 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF4P23510 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF4P23510 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF4P23510 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF4P23510 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF4P23510 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF4P23510 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF4P23510 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF4P23510 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF4P23510 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF4P23510 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF4P23510 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF4P23510 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF4P23510 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF4P23510 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF4P23510 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF4P23510 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF4P23510 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF4P23510 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF4P23510 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF4P23510 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF4P23510 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
TNFSF4P23510 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TNFSF4P23510 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNFSF4P23510 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF4P23510 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF4P23510 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF4P23510 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF4P23510 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF4P23510 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF4P23510 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF4P23510 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF4P23510 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF4P23510 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF4P23510 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF4P23510 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF4P23510 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF4P23510 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF4P23510 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF4P23510 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF4P23510 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF4P23510 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF4P23510 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF4P23510 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF4P23510 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF4P23510 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF4P23510 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF4P23510 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF4P23510 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF4P23510 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF4P23510 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF4P23510 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF4P23510 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF4P23510 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms