Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PVALBP20472 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PVALBP20472 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PVALBP20472 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PVALBP20472 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PVALBP20472 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PVALBP20472 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PVALBP20472 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PVALBP20472 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PVALBP20472 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PVALBP20472 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PVALBP20472 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PVALBP20472 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PVALBP20472 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PVALBP20472 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PVALBP20472 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PVALBP20472 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PVALBP20472 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PVALBP20472 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PVALBP20472 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PVALBP20472 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PVALBP20472 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PVALBP20472 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PVALBP20472 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PVALBP20472 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PVALBP20472 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PVALBP20472 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PVALBP20472 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PVALBP20472 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PVALBP20472 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PVALBP20472 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PVALBP20472 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PVALBP20472 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PVALBP20472 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PVALBP20472 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PVALBP20472 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PVALBP20472 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PVALBP20472 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PVALBP20472 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PVALBP20472 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PVALBP20472 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PVALBP20472 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PVALBP20472 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PVALBP20472 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PVALBP20472 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PVALBP20472 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PVALBP20472 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PVALBP20472 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PVALBP20472 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PVALBP20472 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PVALBP20472 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PVALBP20472 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PVALBP20472 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PVALBP20472 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PVALBP20472 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PVALBP20472 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PVALBP20472 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PVALBP20472 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PVALBP20472 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PVALBP20472 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PVALBP20472 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PVALBP20472 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PVALBP20472 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PVALBP20472 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PVALBP20472 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PVALBP20472 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PVALBP20472 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PVALBP20472 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PVALBP20472 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PVALBP20472 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PVALBP20472 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PVALBP20472 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PVALBP20472 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PVALBP20472 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PVALBP20472 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PVALBP20472 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PVALBP20472 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PVALBP20472 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PVALBP20472 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PVALBP20472 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PVALBP20472 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PVALBP20472 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PVALBP20472 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PVALBP20472 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PVALBP20472 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PVALBP20472 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PVALBP20472 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PVALBP20472 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PVALBP20472 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PVALBP20472 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PVALBP20472 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PVALBP20472 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PVALBP20472 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PVALBP20472 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PVALBP20472 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PVALBP20472 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PVALBP20472 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PVALBP20472 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PVALBP20472 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PVALBP20472 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms