Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXB8P17481 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXB8P17481 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXB8P17481 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXB8P17481 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXB8P17481 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXB8P17481 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXB8P17481 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXB8P17481 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXB8P17481 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXB8P17481 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXB8P17481 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXB8P17481 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXB8P17481 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXB8P17481 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXB8P17481 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXB8P17481 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXB8P17481 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXB8P17481 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXB8P17481 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXB8P17481 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXB8P17481 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HOXB8P17481 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HOXB8P17481 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HOXB8P17481 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXB8P17481 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXB8P17481 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXB8P17481 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXB8P17481 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXB8P17481 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXB8P17481 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXB8P17481 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXB8P17481 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXB8P17481 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXB8P17481 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXB8P17481 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXB8P17481 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXB8P17481 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXB8P17481 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXB8P17481 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXB8P17481 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXB8P17481 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXB8P17481 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXB8P17481 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXB8P17481 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXB8P17481 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXB8P17481 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXB8P17481 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXB8P17481 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXB8P17481 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXB8P17481 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXB8P17481 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXB8P17481 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms