Protein–RNA interactions for Protein: P17050

NAGA, Alpha-N-acetylgalactosaminidase, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAGAP17050 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAGAP17050 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAGAP17050 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAGAP17050 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAGAP17050 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NAGAP17050 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAGAP17050 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NAGAP17050 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAGAP17050 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAGAP17050 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAGAP17050 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NAGAP17050 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAGAP17050 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAGAP17050 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAGAP17050 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAGAP17050 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAGAP17050 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAGAP17050 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAGAP17050 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAGAP17050 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAGAP17050 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAGAP17050 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAGAP17050 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAGAP17050 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAGAP17050 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAGAP17050 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAGAP17050 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NAGAP17050 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAGAP17050 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAGAP17050 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAGAP17050 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAGAP17050 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAGAP17050 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAGAP17050 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAGAP17050 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAGAP17050 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAGAP17050 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAGAP17050 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAGAP17050 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAGAP17050 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAGAP17050 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAGAP17050 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAGAP17050 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAGAP17050 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAGAP17050 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAGAP17050 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAGAP17050 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAGAP17050 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NAGAP17050 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NAGAP17050 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAGAP17050 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAGAP17050 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAGAP17050 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAGAP17050 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAGAP17050 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAGAP17050 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NAGAP17050 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAGAP17050 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAGAP17050 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAGAP17050 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAGAP17050 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAGAP17050 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAGAP17050 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAGAP17050 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAGAP17050 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAGAP17050 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAGAP17050 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAGAP17050 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAGAP17050 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAGAP17050 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAGAP17050 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAGAP17050 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAGAP17050 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NAGAP17050 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAGAP17050 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAGAP17050 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAGAP17050 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAGAP17050 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAGAP17050 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAGAP17050 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAGAP17050 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAGAP17050 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAGAP17050 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAGAP17050 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAGAP17050 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAGAP17050 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAGAP17050 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAGAP17050 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NAGAP17050 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAGAP17050 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAGAP17050 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAGAP17050 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAGAP17050 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NAGAP17050 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NAGAP17050 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NAGAP17050 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NAGAP17050 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NAGAP17050 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAGAP17050 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAGAP17050 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms