Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMP1P11279 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMP1P11279 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMP1P11279 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMP1P11279 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMP1P11279 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMP1P11279 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMP1P11279 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMP1P11279 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMP1P11279 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMP1P11279 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMP1P11279 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMP1P11279 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMP1P11279 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMP1P11279 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMP1P11279 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMP1P11279 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMP1P11279 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMP1P11279 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMP1P11279 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMP1P11279 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMP1P11279 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMP1P11279 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMP1P11279 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMP1P11279 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMP1P11279 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMP1P11279 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMP1P11279 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMP1P11279 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMP1P11279 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMP1P11279 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMP1P11279 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMP1P11279 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMP1P11279 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMP1P11279 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMP1P11279 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMP1P11279 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMP1P11279 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMP1P11279 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms