Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNB1P11230 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNB1P11230 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNB1P11230 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNB1P11230 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNB1P11230 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNB1P11230 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNB1P11230 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNB1P11230 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNB1P11230 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNB1P11230 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNB1P11230 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNB1P11230 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNB1P11230 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNB1P11230 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNB1P11230 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNB1P11230 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNB1P11230 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNB1P11230 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNB1P11230 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNB1P11230 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNB1P11230 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNB1P11230 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNB1P11230 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNB1P11230 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNB1P11230 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNB1P11230 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNB1P11230 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNB1P11230 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNB1P11230 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNB1P11230 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNB1P11230 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNB1P11230 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHRNB1P11230 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CHRNB1P11230 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHRNB1P11230 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNB1P11230 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNB1P11230 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNB1P11230 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNB1P11230 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNB1P11230 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNB1P11230 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNB1P11230 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNB1P11230 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNB1P11230 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNB1P11230 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNB1P11230 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNB1P11230 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNB1P11230 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNB1P11230 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNB1P11230 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNB1P11230 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNB1P11230 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNB1P11230 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNB1P11230 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNB1P11230 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNB1P11230 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNB1P11230 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNB1P11230 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNB1P11230 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRNB1P11230 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRNB1P11230 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNB1P11230 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNB1P11230 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNB1P11230 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNB1P11230 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNB1P11230 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 899.1 ms