Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC172P0C7W6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC172P0C7W6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC172P0C7W6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC172P0C7W6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC172P0C7W6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC172P0C7W6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC172P0C7W6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC172P0C7W6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC172P0C7W6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC172P0C7W6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC172P0C7W6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC172P0C7W6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC172P0C7W6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC172P0C7W6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC172P0C7W6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC172P0C7W6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC172P0C7W6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC172P0C7W6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC172P0C7W6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC172P0C7W6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC172P0C7W6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC172P0C7W6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC172P0C7W6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC172P0C7W6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC172P0C7W6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC172P0C7W6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC172P0C7W6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC172P0C7W6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC172P0C7W6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC172P0C7W6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC172P0C7W6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC172P0C7W6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC172P0C7W6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC172P0C7W6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC172P0C7W6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC172P0C7W6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC172P0C7W6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC172P0C7W6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC172P0C7W6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC172P0C7W6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC172P0C7W6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC172P0C7W6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC172P0C7W6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC172P0C7W6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC172P0C7W6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC172P0C7W6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC172P0C7W6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC172P0C7W6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC172P0C7W6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC172P0C7W6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC172P0C7W6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC172P0C7W6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC172P0C7W6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC172P0C7W6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC172P0C7W6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC172P0C7W6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC172P0C7W6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC172P0C7W6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC172P0C7W6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC172P0C7W6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC172P0C7W6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC172P0C7W6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC172P0C7W6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC172P0C7W6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC172P0C7W6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC172P0C7W6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC172P0C7W6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC172P0C7W6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.1 ms