Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP17L7P0C7H9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP17L7P0C7H9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP17L7P0C7H9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP17L7P0C7H9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
USP17L7P0C7H9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP17L7P0C7H9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP17L7P0C7H9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP17L7P0C7H9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP17L7P0C7H9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP17L7P0C7H9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP17L7P0C7H9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP17L7P0C7H9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP17L7P0C7H9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP17L7P0C7H9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP17L7P0C7H9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP17L7P0C7H9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L7P0C7H9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L7P0C7H9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L7P0C7H9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L7P0C7H9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L7P0C7H9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L7P0C7H9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP17L7P0C7H9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP17L7P0C7H9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
USP17L7P0C7H9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP17L7P0C7H9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP17L7P0C7H9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
USP17L7P0C7H9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP17L7P0C7H9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L7P0C7H9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L7P0C7H9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L7P0C7H9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L7P0C7H9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L7P0C7H9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L7P0C7H9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L7P0C7H9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L7P0C7H9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L7P0C7H9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L7P0C7H9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP17L7P0C7H9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP17L7P0C7H9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
USP17L7P0C7H9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP17L7P0C7H9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP17L7P0C7H9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP17L7P0C7H9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP17L7P0C7H9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP17L7P0C7H9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP17L7P0C7H9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP17L7P0C7H9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP17L7P0C7H9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP17L7P0C7H9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP17L7P0C7H9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
USP17L7P0C7H9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP17L7P0C7H9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
USP17L7P0C7H9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP17L7P0C7H9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP17L7P0C7H9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP17L7P0C7H9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP17L7P0C7H9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP17L7P0C7H9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP17L7P0C7H9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP17L7P0C7H9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP17L7P0C7H9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP17L7P0C7H9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP17L7P0C7H9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP17L7P0C7H9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP17L7P0C7H9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP17L7P0C7H9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms