Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PKHD1P08F94 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKHD1P08F94 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKHD1P08F94 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKHD1P08F94 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms