Protein–RNA interactions for Protein: P08603

CFH, Complement factor H, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHP08603 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFHP08603 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFHP08603 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CFHP08603 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFHP08603 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFHP08603 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFHP08603 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFHP08603 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFHP08603 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFHP08603 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFHP08603 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFHP08603 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFHP08603 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFHP08603 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFHP08603 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFHP08603 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFHP08603 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFHP08603 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFHP08603 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFHP08603 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFHP08603 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CFHP08603 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CFHP08603 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CFHP08603 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFHP08603 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFHP08603 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFHP08603 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFHP08603 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFHP08603 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFHP08603 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFHP08603 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFHP08603 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFHP08603 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CFHP08603 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFHP08603 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFHP08603 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFHP08603 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFHP08603 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFHP08603 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFHP08603 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFHP08603 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFHP08603 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFHP08603 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CFHP08603 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFHP08603 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFHP08603 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFHP08603 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFHP08603 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFHP08603 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFHP08603 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFHP08603 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFHP08603 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFHP08603 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFHP08603 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFHP08603 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFHP08603 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFHP08603 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFHP08603 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFHP08603 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFHP08603 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFHP08603 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFHP08603 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFHP08603 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFHP08603 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFHP08603 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFHP08603 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFHP08603 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFHP08603 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFHP08603 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFHP08603 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CFHP08603 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFHP08603 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CFHP08603 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFHP08603 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CFHP08603 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFHP08603 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFHP08603 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFHP08603 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFHP08603 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFHP08603 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFHP08603 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFHP08603 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFHP08603 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFHP08603 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFHP08603 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFHP08603 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFHP08603 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFHP08603 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CFHP08603 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CFHP08603 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CFHP08603 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CFHP08603 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFHP08603 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFHP08603 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFHP08603 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFHP08603 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFHP08603 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CFHP08603 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFHP08603 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFHP08603 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms