Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFTPBP07988 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFTPBP07988 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFTPBP07988 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFTPBP07988 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFTPBP07988 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFTPBP07988 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFTPBP07988 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFTPBP07988 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SFTPBP07988 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFTPBP07988 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFTPBP07988 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFTPBP07988 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFTPBP07988 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFTPBP07988 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SFTPBP07988 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFTPBP07988 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFTPBP07988 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFTPBP07988 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SFTPBP07988 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFTPBP07988 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFTPBP07988 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFTPBP07988 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFTPBP07988 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFTPBP07988 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFTPBP07988 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFTPBP07988 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFTPBP07988 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SFTPBP07988 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFTPBP07988 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFTPBP07988 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFTPBP07988 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFTPBP07988 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFTPBP07988 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFTPBP07988 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFTPBP07988 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFTPBP07988 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFTPBP07988 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms