Protein–RNA interactions for Protein: P02774

GC, Vitamin D-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCP02774 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GCP02774 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GCP02774 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GCP02774 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GCP02774 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
GCP02774 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
GCP02774 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GCP02774 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GCP02774 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GCP02774 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
GCP02774 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
GCP02774 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GCP02774 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GCP02774 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GCP02774 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GCP02774 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
GCP02774 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
GCP02774 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
GCP02774 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
GCP02774 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
GCP02774 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
GCP02774 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
GCP02774 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
GCP02774 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
GCP02774 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
GCP02774 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GCP02774 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GCP02774 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
GCP02774 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GCP02774 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GCP02774 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GCP02774 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
GCP02774 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GCP02774 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GCP02774 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
GCP02774 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
GCP02774 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GCP02774 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GCP02774 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GCP02774 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
GCP02774 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
GCP02774 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GCP02774 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GCP02774 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GCP02774 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GCP02774 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GCP02774 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GCP02774 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GCP02774 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
GCP02774 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
GCP02774 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GCP02774 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GCP02774 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
GCP02774 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GCP02774 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
GCP02774 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GCP02774 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
GCP02774 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
GCP02774 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GCP02774 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GCP02774 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GCP02774 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GCP02774 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
GCP02774 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
GCP02774 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GCP02774 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GCP02774 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GCP02774 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
GCP02774 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
GCP02774 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
GCP02774 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GCP02774 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GCP02774 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GCP02774 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
GCP02774 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
GCP02774 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
GCP02774 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GCP02774 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
GCP02774 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GCP02774 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GCP02774 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GCP02774 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
GCP02774 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
GCP02774 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GCP02774 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GCP02774 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GCP02774 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
GCP02774 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GCP02774 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GCP02774 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GCP02774 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GCP02774 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GCP02774 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
GCP02774 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GCP02774 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GCP02774 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GCP02774 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GCP02774 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GCP02774 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GCP02774 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms