Protein–RNA interactions for Protein: O95810

CAVIN2, Caveolae-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN2O95810 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAVIN2O95810 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAVIN2O95810 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAVIN2O95810 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAVIN2O95810 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAVIN2O95810 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAVIN2O95810 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAVIN2O95810 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAVIN2O95810 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAVIN2O95810 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAVIN2O95810 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAVIN2O95810 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAVIN2O95810 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAVIN2O95810 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAVIN2O95810 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAVIN2O95810 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAVIN2O95810 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAVIN2O95810 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAVIN2O95810 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAVIN2O95810 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAVIN2O95810 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAVIN2O95810 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAVIN2O95810 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAVIN2O95810 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CAVIN2O95810 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAVIN2O95810 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAVIN2O95810 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAVIN2O95810 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAVIN2O95810 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAVIN2O95810 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAVIN2O95810 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CAVIN2O95810 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CAVIN2O95810 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CAVIN2O95810 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAVIN2O95810 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAVIN2O95810 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAVIN2O95810 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAVIN2O95810 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAVIN2O95810 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAVIN2O95810 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CAVIN2O95810 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAVIN2O95810 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAVIN2O95810 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAVIN2O95810 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAVIN2O95810 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAVIN2O95810 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAVIN2O95810 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAVIN2O95810 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAVIN2O95810 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAVIN2O95810 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAVIN2O95810 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAVIN2O95810 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAVIN2O95810 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAVIN2O95810 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CAVIN2O95810 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAVIN2O95810 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAVIN2O95810 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAVIN2O95810 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAVIN2O95810 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAVIN2O95810 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CAVIN2O95810 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CAVIN2O95810 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAVIN2O95810 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAVIN2O95810 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAVIN2O95810 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAVIN2O95810 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAVIN2O95810 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CAVIN2O95810 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAVIN2O95810 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAVIN2O95810 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAVIN2O95810 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAVIN2O95810 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAVIN2O95810 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAVIN2O95810 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAVIN2O95810 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAVIN2O95810 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAVIN2O95810 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAVIN2O95810 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAVIN2O95810 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAVIN2O95810 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAVIN2O95810 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAVIN2O95810 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAVIN2O95810 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAVIN2O95810 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CAVIN2O95810 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAVIN2O95810 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAVIN2O95810 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAVIN2O95810 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CAVIN2O95810 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAVIN2O95810 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAVIN2O95810 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAVIN2O95810 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAVIN2O95810 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAVIN2O95810 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAVIN2O95810 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAVIN2O95810 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAVIN2O95810 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CAVIN2O95810 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAVIN2O95810 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAVIN2O95810 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms