Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP29O95721 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP29O95721 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP29O95721 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP29O95721 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP29O95721 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP29O95721 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP29O95721 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP29O95721 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP29O95721 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP29O95721 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP29O95721 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP29O95721 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP29O95721 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP29O95721 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP29O95721 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP29O95721 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP29O95721 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP29O95721 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP29O95721 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP29O95721 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP29O95721 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP29O95721 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNAP29O95721 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNAP29O95721 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNAP29O95721 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP29O95721 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP29O95721 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP29O95721 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP29O95721 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP29O95721 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP29O95721 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP29O95721 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP29O95721 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP29O95721 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP29O95721 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP29O95721 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP29O95721 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP29O95721 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP29O95721 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP29O95721 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP29O95721 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP29O95721 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP29O95721 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP29O95721 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP29O95721 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP29O95721 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP29O95721 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP29O95721 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP29O95721 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP29O95721 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP29O95721 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP29O95721 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP29O95721 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP29O95721 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP29O95721 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP29O95721 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP29O95721 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP29O95721 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP29O95721 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP29O95721 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP29O95721 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP29O95721 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP29O95721 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP29O95721 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP29O95721 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP29O95721 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP29O95721 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP29O95721 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP29O95721 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP29O95721 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP29O95721 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP29O95721 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms