Protein–RNA interactions for Protein: O60938

KERA, Keratocan, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KERAO60938 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KERAO60938 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KERAO60938 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KERAO60938 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KERAO60938 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KERAO60938 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KERAO60938 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KERAO60938 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KERAO60938 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KERAO60938 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KERAO60938 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KERAO60938 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KERAO60938 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KERAO60938 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KERAO60938 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KERAO60938 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KERAO60938 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KERAO60938 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KERAO60938 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KERAO60938 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KERAO60938 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KERAO60938 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KERAO60938 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KERAO60938 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KERAO60938 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KERAO60938 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KERAO60938 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KERAO60938 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KERAO60938 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KERAO60938 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KERAO60938 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KERAO60938 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KERAO60938 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KERAO60938 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KERAO60938 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KERAO60938 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KERAO60938 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KERAO60938 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KERAO60938 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KERAO60938 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KERAO60938 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KERAO60938 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KERAO60938 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KERAO60938 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KERAO60938 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KERAO60938 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KERAO60938 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KERAO60938 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KERAO60938 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KERAO60938 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KERAO60938 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KERAO60938 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KERAO60938 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KERAO60938 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KERAO60938 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KERAO60938 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KERAO60938 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KERAO60938 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KERAO60938 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KERAO60938 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KERAO60938 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KERAO60938 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KERAO60938 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KERAO60938 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KERAO60938 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KERAO60938 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KERAO60938 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KERAO60938 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KERAO60938 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KERAO60938 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KERAO60938 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KERAO60938 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KERAO60938 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KERAO60938 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KERAO60938 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KERAO60938 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KERAO60938 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KERAO60938 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KERAO60938 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KERAO60938 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KERAO60938 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KERAO60938 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KERAO60938 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KERAO60938 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KERAO60938 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KERAO60938 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KERAO60938 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KERAO60938 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KERAO60938 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KERAO60938 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KERAO60938 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KERAO60938 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KERAO60938 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KERAO60938 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KERAO60938 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KERAO60938 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KERAO60938 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KERAO60938 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KERAO60938 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KERAO60938 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms