Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTNSO60931 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNSO60931 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNSO60931 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNSO60931 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNSO60931 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNSO60931 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNSO60931 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNSO60931 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNSO60931 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNSO60931 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNSO60931 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNSO60931 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNSO60931 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNSO60931 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNSO60931 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNSO60931 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNSO60931 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNSO60931 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNSO60931 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNSO60931 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNSO60931 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNSO60931 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTNSO60931 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTNSO60931 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTNSO60931 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTNSO60931 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNSO60931 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNSO60931 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNSO60931 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNSO60931 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNSO60931 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNSO60931 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNSO60931 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNSO60931 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNSO60931 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNSO60931 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNSO60931 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNSO60931 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNSO60931 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNSO60931 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNSO60931 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNSO60931 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNSO60931 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNSO60931 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNSO60931 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNSO60931 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNSO60931 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNSO60931 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTNSO60931 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNSO60931 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNSO60931 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNSO60931 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNSO60931 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNSO60931 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNSO60931 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNSO60931 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNSO60931 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNSO60931 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNSO60931 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNSO60931 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNSO60931 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNSO60931 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNSO60931 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNSO60931 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNSO60931 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNSO60931 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNSO60931 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNSO60931 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNSO60931 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNSO60931 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNSO60931 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNSO60931 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNSO60931 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNSO60931 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNSO60931 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNSO60931 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNSO60931 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNSO60931 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNSO60931 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNSO60931 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNSO60931 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNSO60931 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNSO60931 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNSO60931 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNSO60931 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNSO60931 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNSO60931 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNSO60931 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNSO60931 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNSO60931 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNSO60931 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNSO60931 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNSO60931 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNSO60931 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNSO60931 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNSO60931 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNSO60931 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNSO60931 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNSO60931 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms