Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC22O60826 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC22O60826 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC22O60826 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC22O60826 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC22O60826 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC22O60826 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC22O60826 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC22O60826 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC22O60826 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC22O60826 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC22O60826 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC22O60826 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC22O60826 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC22O60826 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC22O60826 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC22O60826 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC22O60826 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC22O60826 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC22O60826 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC22O60826 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC22O60826 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC22O60826 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC22O60826 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC22O60826 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC22O60826 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC22O60826 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC22O60826 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC22O60826 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC22O60826 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC22O60826 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC22O60826 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC22O60826 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC22O60826 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC22O60826 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC22O60826 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC22O60826 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC22O60826 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC22O60826 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC22O60826 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC22O60826 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC22O60826 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC22O60826 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC22O60826 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms