Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCO2O43819 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCO2O43819 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCO2O43819 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCO2O43819 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCO2O43819 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCO2O43819 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCO2O43819 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCO2O43819 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCO2O43819 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCO2O43819 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCO2O43819 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCO2O43819 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCO2O43819 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCO2O43819 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCO2O43819 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCO2O43819 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCO2O43819 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCO2O43819 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCO2O43819 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCO2O43819 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCO2O43819 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCO2O43819 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCO2O43819 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCO2O43819 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCO2O43819 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCO2O43819 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCO2O43819 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCO2O43819 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCO2O43819 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCO2O43819 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCO2O43819 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCO2O43819 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCO2O43819 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCO2O43819 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCO2O43819 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCO2O43819 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCO2O43819 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCO2O43819 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCO2O43819 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCO2O43819 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCO2O43819 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCO2O43819 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCO2O43819 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCO2O43819 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCO2O43819 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCO2O43819 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCO2O43819 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCO2O43819 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCO2O43819 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCO2O43819 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCO2O43819 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCO2O43819 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCO2O43819 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCO2O43819 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCO2O43819 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCO2O43819 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCO2O43819 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCO2O43819 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCO2O43819 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCO2O43819 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCO2O43819 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCO2O43819 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCO2O43819 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCO2O43819 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCO2O43819 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCO2O43819 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SCO2O43819 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCO2O43819 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCO2O43819 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCO2O43819 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCO2O43819 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCO2O43819 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCO2O43819 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SCO2O43819 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCO2O43819 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCO2O43819 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCO2O43819 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCO2O43819 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCO2O43819 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCO2O43819 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCO2O43819 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCO2O43819 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCO2O43819 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCO2O43819 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCO2O43819 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCO2O43819 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCO2O43819 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCO2O43819 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCO2O43819 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCO2O43819 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCO2O43819 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCO2O43819 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCO2O43819 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCO2O43819 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCO2O43819 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCO2O43819 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCO2O43819 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCO2O43819 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCO2O43819 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms