Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRNO43815 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
STRNO43815 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRNO43815 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRNO43815 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
STRNO43815 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
STRNO43815 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
STRNO43815 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRNO43815 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRNO43815 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRNO43815 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
STRNO43815 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRNO43815 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRNO43815 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STRNO43815 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRNO43815 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRNO43815 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRNO43815 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRNO43815 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRNO43815 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRNO43815 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRNO43815 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRNO43815 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRNO43815 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRNO43815 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRNO43815 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRNO43815 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRNO43815 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRNO43815 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
STRNO43815 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRNO43815 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRNO43815 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
STRNO43815 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRNO43815 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRNO43815 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
STRNO43815 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRNO43815 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRNO43815 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRNO43815 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
STRNO43815 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
STRNO43815 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRNO43815 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRNO43815 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRNO43815 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
STRNO43815 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRNO43815 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
STRNO43815 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
STRNO43815 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
STRNO43815 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRNO43815 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRNO43815 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRNO43815 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
STRNO43815 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
STRNO43815 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
STRNO43815 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
STRNO43815 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
STRNO43815 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
STRNO43815 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRNO43815 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
STRNO43815 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRNO43815 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
STRNO43815 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRNO43815 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRNO43815 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRNO43815 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRNO43815 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRNO43815 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRNO43815 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRNO43815 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRNO43815 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRNO43815 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRNO43815 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRNO43815 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRNO43815 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRNO43815 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRNO43815 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRNO43815 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRNO43815 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
STRNO43815 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRNO43815 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRNO43815 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
STRNO43815 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
STRNO43815 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
STRNO43815 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
STRNO43815 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
STRNO43815 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
STRNO43815 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRNO43815 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRNO43815 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRNO43815 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRNO43815 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
STRNO43815 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
STRNO43815 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRNO43815 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRNO43815 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRNO43815 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRNO43815 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRNO43815 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRNO43815 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRNO43815 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms