Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
SYNJ1O43426 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
SYNJ1O43426 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
SYNJ1O43426 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
SYNJ1O43426 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
SYNJ1O43426 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
SYNJ1O43426 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
SYNJ1O43426 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
SYNJ1O43426 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
SYNJ1O43426 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
SYNJ1O43426 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
SYNJ1O43426 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
SYNJ1O43426 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
SYNJ1O43426 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
SYNJ1O43426 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
SYNJ1O43426 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
SYNJ1O43426 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
SYNJ1O43426 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
SYNJ1O43426 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
SYNJ1O43426 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
SYNJ1O43426 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
SYNJ1O43426 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
SYNJ1O43426 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC42.94■■■■■ 4.46
SYNJ1O43426 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.46
SYNJ1O43426 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
SYNJ1O43426 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
SYNJ1O43426 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
SYNJ1O43426 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
SYNJ1O43426 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
SYNJ1O43426 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
SYNJ1O43426 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC42.9■■■■■ 4.46
SYNJ1O43426 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
SYNJ1O43426 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
SYNJ1O43426 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
SYNJ1O43426 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
SYNJ1O43426 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
SYNJ1O43426 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
SYNJ1O43426 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
SYNJ1O43426 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
SYNJ1O43426 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
SYNJ1O43426 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
SYNJ1O43426 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
SYNJ1O43426 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC42.88■■■■■ 4.46
SYNJ1O43426 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
SYNJ1O43426 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
SYNJ1O43426 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC42.87■■■■■ 4.45
SYNJ1O43426 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
SYNJ1O43426 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
SYNJ1O43426 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
SYNJ1O43426 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
SYNJ1O43426 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.84■■■■■ 4.45
SYNJ1O43426 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC42.84■■■■■ 4.45
SYNJ1O43426 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
SYNJ1O43426 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
SYNJ1O43426 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
SYNJ1O43426 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
SYNJ1O43426 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
SYNJ1O43426 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
SYNJ1O43426 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
SYNJ1O43426 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
SYNJ1O43426 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
SYNJ1O43426 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.44
SYNJ1O43426 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
SYNJ1O43426 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
SYNJ1O43426 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
SYNJ1O43426 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
SYNJ1O43426 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
SYNJ1O43426 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC42.79■■■■■ 4.44
SYNJ1O43426 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
SYNJ1O43426 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.78■■■■■ 4.44
SYNJ1O43426 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
SYNJ1O43426 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
SYNJ1O43426 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
SYNJ1O43426 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
SYNJ1O43426 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
SYNJ1O43426 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC42.77■■■■■ 4.44
SYNJ1O43426 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC42.76■■■■■ 4.44
SYNJ1O43426 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC42.76■■■■■ 4.44
SYNJ1O43426 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
SYNJ1O43426 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
SYNJ1O43426 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
SYNJ1O43426 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
SYNJ1O43426 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
SYNJ1O43426 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
SYNJ1O43426 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
SYNJ1O43426 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
SYNJ1O43426 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
SYNJ1O43426 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
SYNJ1O43426 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
SYNJ1O43426 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC42.69■■■■■ 4.43
SYNJ1O43426 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
SYNJ1O43426 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
SYNJ1O43426 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
SYNJ1O43426 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
SYNJ1O43426 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
SYNJ1O43426 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
SYNJ1O43426 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
SYNJ1O43426 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
SYNJ1O43426 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC42.66■■■■■ 4.42
SYNJ1O43426 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms