Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAFD1O14545 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAFD1O14545 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAFD1O14545 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAFD1O14545 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAFD1O14545 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAFD1O14545 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAFD1O14545 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAFD1O14545 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAFD1O14545 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAFD1O14545 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAFD1O14545 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAFD1O14545 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAFD1O14545 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAFD1O14545 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAFD1O14545 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAFD1O14545 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAFD1O14545 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAFD1O14545 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAFD1O14545 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAFD1O14545 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAFD1O14545 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAFD1O14545 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAFD1O14545 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAFD1O14545 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAFD1O14545 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAFD1O14545 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAFD1O14545 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAFD1O14545 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAFD1O14545 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAFD1O14545 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAFD1O14545 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAFD1O14545 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAFD1O14545 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAFD1O14545 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAFD1O14545 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAFD1O14545 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAFD1O14545 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAFD1O14545 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAFD1O14545 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAFD1O14545 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAFD1O14545 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAFD1O14545 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAFD1O14545 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAFD1O14545 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAFD1O14545 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAFD1O14545 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAFD1O14545 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAFD1O14545 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAFD1O14545 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAFD1O14545 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAFD1O14545 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAFD1O14545 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAFD1O14545 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAFD1O14545 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAFD1O14545 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAFD1O14545 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAFD1O14545 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAFD1O14545 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAFD1O14545 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAFD1O14545 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAFD1O14545 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAFD1O14545 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAFD1O14545 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAFD1O14545 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAFD1O14545 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAFD1O14545 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAFD1O14545 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAFD1O14545 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
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