Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PTPRTO14522 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PTPRTO14522 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PTPRTO14522 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PTPRTO14522 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PTPRTO14522 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PTPRTO14522 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PTPRTO14522 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PTPRTO14522 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PTPRTO14522 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
PTPRTO14522 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
PTPRTO14522 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.4■■■■□ 3.58
PTPRTO14522 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PTPRTO14522 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
PTPRTO14522 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
PTPRTO14522 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PTPRTO14522 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PTPRTO14522 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PTPRTO14522 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
PTPRTO14522 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PTPRTO14522 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PTPRTO14522 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PTPRTO14522 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PTPRTO14522 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPRTO14522 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPRTO14522 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPRTO14522 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPRTO14522 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPRTO14522 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPRTO14522 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPRTO14522 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
PTPRTO14522 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
PTPRTO14522 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PTPRTO14522 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PTPRTO14522 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PTPRTO14522 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.57
PTPRTO14522 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PTPRTO14522 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PTPRTO14522 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PTPRTO14522 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PTPRTO14522 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
PTPRTO14522 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PTPRTO14522 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PTPRTO14522 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PTPRTO14522 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
PTPRTO14522 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PTPRTO14522 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
PTPRTO14522 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
PTPRTO14522 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PTPRTO14522 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
PTPRTO14522 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PTPRTO14522 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PTPRTO14522 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PTPRTO14522 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PTPRTO14522 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PTPRTO14522 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PTPRTO14522 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PTPRTO14522 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PTPRTO14522 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PTPRTO14522 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PTPRTO14522 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
PTPRTO14522 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
PTPRTO14522 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
PTPRTO14522 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
PTPRTO14522 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.55
PTPRTO14522 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
PTPRTO14522 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PTPRTO14522 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PTPRTO14522 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PTPRTO14522 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PTPRTO14522 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PTPRTO14522 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PTPRTO14522 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PTPRTO14522 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PTPRTO14522 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PTPRTO14522 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PTPRTO14522 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
PTPRTO14522 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PTPRTO14522 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PTPRTO14522 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
PTPRTO14522 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PTPRTO14522 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
PTPRTO14522 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PTPRTO14522 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PTPRTO14522 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PTPRTO14522 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PTPRTO14522 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PTPRTO14522 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PTPRTO14522 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PTPRTO14522 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PTPRTO14522 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PTPRTO14522 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PTPRTO14522 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PTPRTO14522 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRTO14522 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPRTO14522 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPRTO14522 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPRTO14522 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPRTO14522 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPRTO14522 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
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