Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
H3BNH8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H3BNH8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
H3BNH8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H3BNH8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
H3BNH8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
H3BNH8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H3BNH8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BNH8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BNH8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BNH8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BNH8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BNH8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BNH8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BNH8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BNH8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BNH8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BNH8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BNH8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BNH8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BNH8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BNH8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BNH8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BNH8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BNH8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BNH8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BNH8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BNH8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BNH8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BNH8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BNH8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BNH8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BNH8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BNH8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BNH8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BNH8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BNH8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
H3BNH8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
H3BNH8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BNH8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BNH8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BNH8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BNH8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BNH8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BNH8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BNH8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BNH8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BNH8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BNH8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BNH8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BNH8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BNH8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BNH8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BNH8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BNH8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BNH8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BNH8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BNH8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BNH8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BNH8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BNH8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BNH8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BNH8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BNH8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BNH8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
H3BNH8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
H3BNH8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H3BNH8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H3BNH8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BNH8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BNH8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BNH8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BNH8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BNH8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BNH8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BNH8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
H3BNH8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H3BNH8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
H3BNH8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
H3BNH8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H3BNH8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H3BNH8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H3BNH8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H3BNH8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BNH8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BNH8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BNH8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BNH8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BNH8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BNH8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BNH8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BNH8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BNH8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H3BNH8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
H3BNH8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H3BNH8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H3BNH8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
H3BNH8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
H3BNH8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H3BNH8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms