Protein–RNA interactions for Protein: H0YCG3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H0YCG3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
H0YCG3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
H0YCG3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
H0YCG3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
H0YCG3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
H0YCG3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
H0YCG3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
H0YCG3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
H0YCG3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
H0YCG3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
H0YCG3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
H0YCG3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
H0YCG3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
H0YCG3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
H0YCG3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
H0YCG3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
H0YCG3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
H0YCG3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
H0YCG3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
H0YCG3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
H0YCG3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
H0YCG3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
H0YCG3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
H0YCG3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
H0YCG3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
H0YCG3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
H0YCG3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
H0YCG3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
H0YCG3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
H0YCG3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
H0YCG3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
H0YCG3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
H0YCG3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
H0YCG3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
H0YCG3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
H0YCG3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
H0YCG3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
H0YCG3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
H0YCG3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
H0YCG3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
H0YCG3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
H0YCG3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
H0YCG3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
H0YCG3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
H0YCG3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
H0YCG3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
H0YCG3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
H0YCG3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
H0YCG3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
H0YCG3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
H0YCG3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
H0YCG3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
H0YCG3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
H0YCG3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
H0YCG3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
H0YCG3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
H0YCG3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
H0YCG3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
H0YCG3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
H0YCG3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
H0YCG3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
H0YCG3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
H0YCG3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
H0YCG3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
H0YCG3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
H0YCG3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
H0YCG3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
H0YCG3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
H0YCG3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
H0YCG3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
H0YCG3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
H0YCG3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
H0YCG3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
H0YCG3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
H0YCG3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
H0YCG3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
H0YCG3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
H0YCG3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
H0YCG3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.58■■■□□ 2
H0YCG3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
H0YCG3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
H0YCG3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
H0YCG3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
H0YCG3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
H0YCG3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
H0YCG3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
H0YCG3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
H0YCG3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.55■■■□□ 2
H0YCG3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
H0YCG3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
H0YCG3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
H0YCG3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
H0YCG3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
H0YCG3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
H0YCG3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
H0YCG3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
H0YCG3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
H0YCG3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
H0YCG3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
H0YCG3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms