Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA6CA6NDK9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA6CA6NDK9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA6CA6NDK9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA6CA6NDK9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GOLGA6CA6NDK9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GOLGA6CA6NDK9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GOLGA6CA6NDK9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA6CA6NDK9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA6CA6NDK9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA6CA6NDK9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA6CA6NDK9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6CA6NDK9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6CA6NDK9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6CA6NDK9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6CA6NDK9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6CA6NDK9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6CA6NDK9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6CA6NDK9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6CA6NDK9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6CA6NDK9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6CA6NDK9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6CA6NDK9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GOLGA6CA6NDK9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA6CA6NDK9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GOLGA6CA6NDK9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
GOLGA6CA6NDK9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GOLGA6CA6NDK9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GOLGA6CA6NDK9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA6CA6NDK9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA6CA6NDK9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA6CA6NDK9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA6CA6NDK9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA6CA6NDK9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA6CA6NDK9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA6CA6NDK9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms