Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPL8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPL8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1W2PPL8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1W2PPL8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PPL8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1W2PPL8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PPL8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PPL8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PPL8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PPL8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PPL8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PPL8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PPL8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PPL8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PPL8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PPL8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PPL8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PPL8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PPL8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PPL8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PPL8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PPL8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PPL8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PPL8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PPL8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PPL8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PPL8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PPL8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PPL8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PPL8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PPL8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
A0A1W2PPL8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPL8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPL8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPL8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPL8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPL8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms