RNA–Protein interactions for RNA: YGR008C

STF2, Transcript of Protein involved in resistance to desiccation stress, yeastyeast

Gene STF2, Length 255 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
STF2YGR008C FAP1P53971 965 aa7.98□□□□□ -1.13
STF2YGR008C MTC1P47018 478 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
STF2YGR008C PRY3P47033 881 aa7.52□□□□□ -1.21
STF2YGR008C YCK3P39962 524 aa7.01□□□□□ -1.29
STF2YGR008C AAD16Q02895 342 aa7□□□□□ -1.29
STF2YGR008C PRI1P10363 409 aa6.95□□□□□ -1.3
STF2YGR008C HAA1Q12753 694 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
STF2YGR008C TSR3Q12094 313 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
STF2YGR008C RPG1P38249 964 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
STF2YGR008C ISW2Q08773 1120 aa6.59□□□□□ -1.35
STF2YGR008C DRS1P32892 752 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
STF2YGR008C MRPL32P25348 183 aa6.29□□□□□ -1.4
STF2YGR008C YGL015CP33199 130 aa6.2□□□□□ -1.42
STF2YGR008C BUD31P25337 157 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
STF2YGR008C DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
STF2YGR008C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
STF2YGR008C REB1P21538 810 aa5.94□□□□□ -1.46
STF2YGR008C RPL17AP05740 184 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
STF2YGR008C RPL17BP46990 184 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
STF2YGR008C CDC27P38042 758 aa5.89□□□□□ -1.47
STF2YGR008C MAP2P38174 421 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
STF2YGR008C SIS1P25294 352 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
STF2YGR008C UBP10P53874 792 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
STF2YGR008C DCD1P06773 312 aa5.68□□□□□ -1.5
STF2YGR008C YKR023WP36119 530 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
STF2YGR008C HOP09932 586 aa5.62□□□□□ -1.51
STF2YGR008C SCY1P53009 804 aa5.56□□□□□ -1.52
STF2YGR008C UBP9P39967 754 aa5.53□□□□□ -1.52
STF2YGR008C TFC8Q12308 588 aa5.52□□□□□ -1.53
STF2YGR008C SPT21P35209 758 aa5.51□□□□□ -1.53
STF2YGR008C AVT3P36062 692 aa5.51□□□□□ -1.53
STF2YGR008C TIF4632P39936 914 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
STF2YGR008C SLX5P32828 619 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
STF2YGR008C TGL3P40308 642 aa5.44□□□□□ -1.54
STF2YGR008C BCH2P36122 765 aa5.33□□□□□ -1.56
STF2YGR008C YBL029C-AQ3E756 94 aa5.31□□□□□ -1.56
STF2YGR008C EPS1P40557 701 aa5.15□□□□□ -1.59
STF2YGR008C BDF1P35817 686 aa5.14□□□□□ -1.59
STF2YGR008C WSC3Q12215 556 aa5.14□□□□□ -1.59
STF2YGR008C VNX1P42839 908 aa5.13□□□□□ -1.59
STF2YGR008C RIM101P33400 625 aa5.12□□□□□ -1.59
STF2YGR008C SPP1Q03012 353 aa5.11□□□□□ -1.59
STF2YGR008C YOR238WQ08634 303 aa5.11□□□□□ -1.59
STF2YGR008C MST1P07236 462 aa5.09□□□□□ -1.59
STF2YGR008C BFR2Q06631 534 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
STF2YGR008C YJL171CP46992 396 aa5.07□□□□□ -1.6
STF2YGR008C AIR2Q12476 344 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
STF2YGR008C PTP3P40048 928 aa5□□□□□ -1.61
STF2YGR008C FKH1P40466 484 aa5□□□□□ -1.61
STF2YGR008C OXP1P28273 1286 aa4.98□□□□□ -1.61
STF2YGR008C TIF11P38912 153 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
STF2YGR008C YAP5P40574 245 aa4.97□□□□□ -1.61
STF2YGR008C LDB19Q12502 818 aa4.96□□□□□ -1.62
STF2YGR008C GTT3P39996 337 aa4.95□□□□□ -1.62
STF2YGR008C PIB1Q06651 286 aa4.93□□□□□ -1.62
STF2YGR008C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data4.92□□□□□ -1.62not detected
STF2YGR008C YIL055CP40523 627 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
STF2YGR008C BMT6Q12291 365 aa4.91□□□□□ -1.62
STF2YGR008C ULI1P43604 169 aa4.89□□□□□ -1.63
STF2YGR008C BBC1P47068 1157 aa4.89□□□□□ -1.63
STF2YGR008C AI2P03876 854 aa4.86□□□□□ -1.63
STF2YGR008C IOC2Q12072 812 aa4.84□□□□□ -1.63
STF2YGR008C YAH1Q12184 172 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
STF2YGR008C RSM7P47150 247 aa4.81□□□□□ -1.64
STF2YGR008C RTG1P32607 177 aa4.77□□□□□ -1.65
STF2YGR008C SET4P42948 560 aa4.76□□□□□ -1.65
STF2YGR008C TRP5P00931 707 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
STF2YGR008C NCR1Q12200 1170 aa4.72□□□□□ -1.65
STF2YGR008C YOL036WQ08206 761 aa4.7□□□□□ -1.66
STF2YGR008C MRM1P25270 412 aa4.69□□□□□ -1.66
STF2YGR008C EAP1P36041 632 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
STF2YGR008C MSB4Q12317 492 aa4.68□□□□□ -1.66
STF2YGR008C SAP30P38429 201 aa4.65□□□□□ -1.67
STF2YGR008C YFR006WP43590 535 aa4.65□□□□□ -1.67
STF2YGR008C YNL035CP53962 389 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
STF2YGR008C BCK2P33306 851 aa4.63□□□□□ -1.67
STF2YGR008C YLR271WQ06152 274 aa4.62□□□□□ -1.67
STF2YGR008C SEC61P32915 480 aa4.61□□□□□ -1.67
STF2YGR008C TFG1P41895 735 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
STF2YGR008C DBP1P24784 617 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
STF2YGR008C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
STF2YGR008C VMA1P17255 1071 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
STF2YGR008C CHL1P22516 861 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
STF2YGR008C STS1P38637 319 aa4.54□□□□□ -1.68
STF2YGR008C YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data4.54□□□□□ -1.68not detected
STF2YGR008C PRE3P38624 215 aa4.52□□□□□ -1.69
STF2YGR008C VPS29P38759 282 aa4.52□□□□□ -1.69
STF2YGR008C DAN4P47179 1161 aa4.52□□□□□ -1.69
STF2YGR008C YDR344CQ05510 147 aa4.52□□□□□ -1.69
STF2YGR008C YDL129WQ07555 291 aa4.52□□□□□ -1.69
STF2YGR008C VRP1P37370 817 aa4.5□□□□□ -1.69
STF2YGR008C DCW1P36091 449 aa4.49□□□□□ -1.69
STF2YGR008C SAM3Q08986 587 aa4.48□□□□□ -1.69
STF2YGR008C INO80P53115 1489 aa4.48□□□□□ -1.69
STF2YGR008C CST9Q06032 482 aa4.47□□□□□ -1.69
STF2YGR008C DPS1P04802 557 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
STF2YGR008C RTG3P38165 486 aa4.46□□□□□ -1.7
STF2YGR008C JIP4Q03361 876 aa4.46□□□□□ -1.7
STF2YGR008C GYP5Q12344 894 aa4.46□□□□□ -1.7
STF2YGR008C HTA1P04911 132 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.2 ms