RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621941.1

5S_rRNA.18-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 110 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CHIC1Q5VXU3 224 aa6.2□□□□□ -1.42
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PLPPR3Q6T4P5 718 aa5.19□□□□□ -1.58
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 EHMT2Q96KQ7 1210 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ADRA2BP18089 450 aa4.84□□□□□ -1.63
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 KCNA4P22459 653 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PPP6R1Q9UPN7 881 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 FOXD1Q16676 465 aa4.73□□□□□ -1.65
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa4.61□□□□□ -1.67
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CSRNP3Q8WYN3 585 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 NPM3O75607 178 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
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5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa4.42□□□□□ -1.7
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5S_rRNA.18-201ENST00000621941 FOXD4L1Q9NU39 408 aa4.34□□□□□ -1.71
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SLC24A1O60721 1099 aa4.3□□□□□ -1.72
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MSH5O43196 834 aa4.29□□□□□ -1.72
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
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5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SLC4A2P04920 1241 aa4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ATXN8OSP0DMR3 200 aa4.14□□□□□ -1.75
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DMRT2Q9Y5R5 561 aa4.13□□□□□ -1.75
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DCAF8L1A6NGE4 600 aa4.07□□□□□ -1.76
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP4.04□□□□□ -1.76
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
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5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
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5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PLCB2Q00722 1185 aa3.93□□□□□ -1.78
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 APLP2Q06481 763 aa3.93□□□□□ -1.78
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
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5S_rRNA.18-201ENST00000621941 KLHL34Q8N239 644 aa3.84□□□□□ -1.79
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
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5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 POLA2Q14181 598 aa3.81□□□□□ -1.8
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CFAP44Q96MT7 982 aa3.81□□□□□ -1.8
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5S_rRNA.18-201ENST00000621941 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP3.72□□□□□ -1.81
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5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP3.68□□□□□ -1.82
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5S_rRNA.18-201ENST00000621941 OSCARQ8IYS5 282 aa3.65□□□□□ -1.83
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 TRIM41Q8WV44 630 aa3.63□□□□□ -1.83
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 GSE1Q14687 1217 aa3.62□□□□□ -1.83
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DCAF8Q5TAQ9 597 aa3.62□□□□□ -1.83
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 HS6ST3Q8IZP7 471 aa3.61□□□□□ -1.83
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SSUH2Q9Y2M2 353 aa3.61□□□□□ -1.83
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5S_rRNA.18-201ENST00000621941 STK25O00506 426 aa3.59□□□□□ -1.83
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