RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439892.5

PCBP1-AS1-231, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCBP1-AS1, Length 578 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-231ENST00000439892 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.44■■□□□ 1.18
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PCBP1-AS1-231ENST00000439892 DCAF8L1A6NGE4 600 aa14.53□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-231ENST00000439892 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.093e-8■■□□□ 13.5
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PCBP1-AS1-231ENST00000439892 SSUH2Q9Y2M2 353 aa13.07□□□□□ -0.32
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PCBP1-AS1-231ENST00000439892 CFAP44Q96MT7 982 aa12.81□□□□□ -0.36
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PCBP1-AS1-231ENST00000439892 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
PCBP1-AS1-231ENST00000439892 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa12.78□□□□□ -0.36
PCBP1-AS1-231ENST00000439892 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP12.76□□□□□ -0.37
PCBP1-AS1-231ENST00000439892 CHGAP10645 457 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
PCBP1-AS1-231ENST00000439892 GSE1Q14687 1217 aa12.72□□□□□ -0.37
PCBP1-AS1-231ENST00000439892 TAOK2Q9UL54 1235 aa12.69□□□□□ -0.38
PCBP1-AS1-231ENST00000439892 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
PCBP1-AS1-231ENST00000439892 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
PCBP1-AS1-231ENST00000439892 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa12.62□□□□□ -0.39
PCBP1-AS1-231ENST00000439892 DCAF8Q5TAQ9 597 aa12.59□□□□□ -0.39
PCBP1-AS1-231ENST00000439892 HS6ST3Q8IZP7 471 aa12.58□□□□□ -0.4
PCBP1-AS1-231ENST00000439892 AKT1S1Q96B36 256 aa12.58□□□□□ -0.4
PCBP1-AS1-231ENST00000439892 PRR29P0C7W0 189 aa12.55□□□□□ -0.4
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