RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438196.2

RPS29P6-201, Transcript of ribosomal protein S29 pseudogene 6, humanhuman

BASIC

Gene RPS29P6, Length 145 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P6-201ENST00000438196 NISCHQ9Y2I1 1504 aa6.24□□□□□ -1.41
RPS29P6-201ENST00000438196 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa5.34□□□□□ -1.56
RPS29P6-201ENST00000438196 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
RPS29P6-201ENST00000438196 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa5.2□□□□□ -1.58
RPS29P6-201ENST00000438196 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa5.1□□□□□ -1.59
RPS29P6-201ENST00000438196 MYO15BQ96JP2 1530 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS29P6-201ENST00000438196 CHIC1Q5VXU3 224 aa5.04□□□□□ -1.6
RPS29P6-201ENST00000438196 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RPS29P6-201ENST00000438196 DCAF8L2P0C7V8 631 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS29P6-201ENST00000438196 ABCC9O60706 1549 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS29P6-201ENST00000438196 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RPS29P6-201ENST00000438196 NACADO15069 1562 aa4.89□□□□□ -1.63
RPS29P6-201ENST00000438196 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS29P6-201ENST00000438196 SCRIBQ14160 1630 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS29P6-201ENST00000438196 HRCP23327 699 aa4.85□□□□□ -1.63
RPS29P6-201ENST00000438196 CECR2Q9BXF3 1484 aa4.85□□□□□ -1.63
RPS29P6-201ENST00000438196 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RPS29P6-201ENST00000438196 MROH2BQ7Z745 1585 aa4.84□□□□□ -1.63
RPS29P6-201ENST00000438196 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa4.83□□□□□ -1.64
RPS29P6-201ENST00000438196 UNC13AQ9UPW8 1703 aa4.82□□□□□ -1.64
RPS29P6-201ENST00000438196 WIZO95785 1651 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P6-201ENST00000438196 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RPS29P6-201ENST00000438196 BICRAQ9NZM4 1560 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS29P6-201ENST00000438196 PCGF6Q9BYE7 350 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS29P6-201ENST00000438196 SMARCA4P51532 1647 aa4.74□□□□□ -1.65
RPS29P6-201ENST00000438196 PEG3Q9GZU2 1588 aa4.74□□□□□ -1.65
RPS29P6-201ENST00000438196 SMARCA2P51531 1590 aa4.73□□□□□ -1.65
RPS29P6-201ENST00000438196 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RPS29P6-201ENST00000438196 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
RPS29P6-201ENST00000438196 CCDC88BA6NC98 1476 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS29P6-201ENST00000438196 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RPS29P6-201ENST00000438196 TRIM41Q8WV44 630 aa4.69□□□□□ -1.66
RPS29P6-201ENST00000438196 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP4.66□□□□□ -1.66
RPS29P6-201ENST00000438196 ABCC8Q09428 1581 aa4.65□□□□□ -1.67
RPS29P6-201ENST00000438196 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa4.63□□□□□ -1.67
RPS29P6-201ENST00000438196 SOGA1O94964 1423 aa4.63□□□□□ -1.67
RPS29P6-201ENST00000438196 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP4.61□□□□□ -1.67
RPS29P6-201ENST00000438196 TNIKQ9UKE5 1360 aa4.61□□□□□ -1.67
RPS29P6-201ENST00000438196 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa4.61□□□□□ -1.67
RPS29P6-201ENST00000438196 SYNJ1O43426 1573 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS29P6-201ENST00000438196 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RPS29P6-201ENST00000438196 EEA1Q15075 1411 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS29P6-201ENST00000438196 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RPS29P6-201ENST00000438196 KIF21BO75037 1637 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS29P6-201ENST00000438196 CSRNP3Q8WYN3 585 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS29P6-201ENST00000438196 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa4.57□□□□□ -1.68
RPS29P6-201ENST00000438196 TOP2BQ02880 1626 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS29P6-201ENST00000438196 NCAPD3P42695 1498 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS29P6-201ENST00000438196 CEP162Q5TB80 1403 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS29P6-201ENST00000438196 HMGXB3Q12766 1538 aa4.53□□□□□ -1.68
RPS29P6-201ENST00000438196 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RPS29P6-201ENST00000438196 GOLGA3Q08378 1498 aa4.52□□□□□ -1.69
RPS29P6-201ENST00000438196 PRXQ9BXM0 1461 aa4.52□□□□□ -1.69
RPS29P6-201ENST00000438196 PRDM2Q13029 1718 aa4.51□□□□□ -1.69
RPS29P6-201ENST00000438196 CEP164Q9UPV0 1460 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS29P6-201ENST00000438196 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS29P6-201ENST00000438196 CLIP1P30622 1438 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS29P6-201ENST00000438196 CUX1P39880 1505 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS29P6-201ENST00000438196 ERICH3Q5RHP9 1530 aa4.5□□□□□ -1.69
RPS29P6-201ENST00000438196 CFTRP13569 1480 aa4.49□□□□□ -1.69
RPS29P6-201ENST00000438196 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RPS29P6-201ENST00000438196 VPS8Q8N3P4 1428 aa4.47□□□□□ -1.69
RPS29P6-201ENST00000438196 EHMT2Q96KQ7 1210 aa4.47□□□□□ -1.69
RPS29P6-201ENST00000438196 ARAP1Q96P48 1450 aa4.47□□□□□ -1.69
RPS29P6-201ENST00000438196 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RPS29P6-201ENST00000438196 CUX2O14529 1486 aa4.45□□□□□ -1.7
RPS29P6-201ENST00000438196 IGF1RP08069 1367 aa4.44□□□□□ -1.7
RPS29P6-201ENST00000438196 MAP3K1Q13233 1512 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS29P6-201ENST00000438196 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
RPS29P6-201ENST00000438196 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa4.43□□□□□ -1.7
RPS29P6-201ENST00000438196 UBTFP17480 764 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
RPS29P6-201ENST00000438196 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
RPS29P6-201ENST00000438196 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
RPS29P6-201ENST00000438196 CADPSQ9ULU8 1353 aa4.4□□□□□ -1.7
RPS29P6-201ENST00000438196 CLSPNQ9HAW4 1339 aa4.4□□□□□ -1.71
RPS29P6-201ENST00000438196 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
RPS29P6-201ENST00000438196 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
RPS29P6-201ENST00000438196 KIF27Q86VH2 1401 aa4.39□□□□□ -1.71
RPS29P6-201ENST00000438196 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
RPS29P6-201ENST00000438196 NEUROD1Q13562 356 aa4.39□□□□□ -1.71
RPS29P6-201ENST00000438196 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
RPS29P6-201ENST00000438196 WDR97A6NE52 1622 aa4.38□□□□□ -1.71
RPS29P6-201ENST00000438196 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS29P6-201ENST00000438196 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS29P6-201ENST00000438196 FGD5Q6ZNL6 1462 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS29P6-201ENST00000438196 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa4.36□□□□□ -1.71
RPS29P6-201ENST00000438196 TIAM1Q13009 1591 aa4.36□□□□□ -1.71
RPS29P6-201ENST00000438196 MAPKBP1O60336 1514 aa4.36□□□□□ -1.71
RPS29P6-201ENST00000438196 CFAP43Q8NDM7 1665 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS29P6-201ENST00000438196 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP4.35□□□□□ -1.71
RPS29P6-201ENST00000438196 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS29P6-201ENST00000438196 DNMBPQ6XZF7 1577 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS29P6-201ENST00000438196 MIER1Q8N108 512 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS29P6-201ENST00000438196 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS29P6-201ENST00000438196 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP4.34□□□□□ -1.71
RPS29P6-201ENST00000438196 TOPBP1Q92547 1522 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS29P6-201ENST00000438196 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS29P6-201ENST00000438196 SAMD9Q5K651 1589 aa4.33□□□□□ -1.72
RPS29P6-201ENST00000438196 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
RPS29P6-201ENST00000438196 FANCD2Q9BXW9 1451 aa4.33□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms