RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411028.1

RNU6-272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 272, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-272P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-272P-201ENST00000411028 CHIC1Q5VXU3 224 aa16.5■□□□□ 0.23
RNU6-272P-201ENST00000411028 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
RNU6-272P-201ENST00000411028 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RNU6-272P-201ENST00000411028 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
RNU6-272P-201ENST00000411028 PLPPR3Q6T4P5 718 aa13.66□□□□□ -0.22
RNU6-272P-201ENST00000411028 ADRA2BP18089 450 aa12.74□□□□□ -0.37
RNU6-272P-201ENST00000411028 FOXD1Q16676 465 aa12.64□□□□□ -0.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 PPP6R1Q9UPN7 881 aa12.64□□□□□ -0.39
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RNU6-272P-201ENST00000411028 EHMT2Q96KQ7 1210 aa12.32□□□□□ -0.44
RNU6-272P-201ENST00000411028 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa12.11□□□□□ -0.47
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RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 CSRNP3Q8WYN3 585 aa11.96□□□□□ -0.49
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RNU6-272P-201ENST00000411028 DMRT2Q9Y5R5 561 aa11.05□□□□□ -0.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC4A2P04920 1241 aa10.99□□□□□ -0.65
RNU6-272P-201ENST00000411028 ATXN8OSP0DMR3 200 aa10.94□□□□□ -0.66
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RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC24A1O60721 1099 aa10.81□□□□□ -0.68
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RNU6-272P-201ENST00000411028 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
RNU6-272P-201ENST00000411028 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
RNU6-272P-201ENST00000411028 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
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RNU6-272P-201ENST00000411028 APLP2Q06481 763 aa10.27□□□□□ -0.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 FBXO3Q9UK99 471 aa10.24□□□□□ -0.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPDYE4A6NLX3 237 aa10.17□□□□□ -0.78
RNU6-272P-201ENST00000411028 PROM2Q8N271 834 aa10.15□□□□□ -0.78
RNU6-272P-201ENST00000411028 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
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RNU6-272P-201ENST00000411028 POLA2Q14181 598 aa9.95□□□□□ -0.82
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RNU6-272P-201ENST00000411028 PKD2Q13563 968 aa9.88□□□□□ -0.83
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
RNU6-272P-201ENST00000411028 RNF39Q9H2S5 420 aa9.86□□□□□ -0.83
RNU6-272P-201ENST00000411028 CAPN15O75808 1086 aa9.85□□□□□ -0.83
RNU6-272P-201ENST00000411028 DCAF8L2P0C7V8 631 aa9.84□□□□□ -0.83
RNU6-272P-201ENST00000411028 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
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RNU6-272P-201ENST00000411028 VSIG10Q8N0Z9 540 aa9.78□□□□□ -0.84
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPOCK2Q92563 424 aa9.77□□□□□ -0.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 BCANQ96GW7 911 aa9.75□□□□□ -0.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 STAG3Q9UJ98 1225 aa9.74□□□□□ -0.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 KLHL34Q8N239 644 aa9.73□□□□□ -0.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
RNU6-272P-201ENST00000411028 ABCB7O75027 752 aa9.71□□□□□ -0.86
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RNU6-272P-201ENST00000411028 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
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RNU6-272P-201ENST00000411028 SPDYE6P0CI01 402 aa9.65□□□□□ -0.86
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPDYE2Q495Y8 402 aa9.65□□□□□ -0.86
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RNU6-272P-201ENST00000411028 SSUH2Q9Y2M2 353 aa9.64□□□□□ -0.87
RNU6-272P-201ENST00000411028 PLCD3Q8N3E9 789 aa9.62□□□□□ -0.87
RNU6-272P-201ENST00000411028 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
RNU6-272P-201ENST00000411028 TAOK2Q9UL54 1235 aa9.6□□□□□ -0.87
RNU6-272P-201ENST00000411028 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa9.59□□□□□ -0.87
RNU6-272P-201ENST00000411028 RGL2O15211 777 aa9.58□□□□□ -0.88
RNU6-272P-201ENST00000411028 DSG3P32926 999 aa9.58□□□□□ -0.88
RNU6-272P-201ENST00000411028 MIER1Q8N108 512 aa9.57□□□□□ -0.88
RNU6-272P-201ENST00000411028 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP9.56□□□□□ -0.88
RNU6-272P-201ENST00000411028 OSCARQ8IYS5 282 aa9.56□□□□□ -0.88
RNU6-272P-201ENST00000411028 CFAP44Q96MT7 982 aa9.56□□□□□ -0.88
RNU6-272P-201ENST00000411028 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
RNU6-272P-201ENST00000411028 PLEKHG5O94827 1062 aa9.5□□□□□ -0.89
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRIM41Q8WV44 630 aa9.48□□□□□ -0.89
RNU6-272P-201ENST00000411028 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
RNU6-272P-201ENST00000411028 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.46□□□□□ -0.9
RNU6-272P-201ENST00000411028 CHGAP10645 457 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
RNU6-272P-201ENST00000411028 TPRNQ4KMQ1 711 aa9.43□□□□□ -0.9
RNU6-272P-201ENST00000411028 HS6ST3Q8IZP7 471 aa9.4□□□□□ -0.9
RNU6-272P-201ENST00000411028 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa9.4□□□□□ -0.9
RNU6-272P-201ENST00000411028 GSE1Q14687 1217 aa9.36□□□□□ -0.91
RNU6-272P-201ENST00000411028 POTEDQ86YR6 584 aa9.33□□□□□ -0.92
RNU6-272P-201ENST00000411028 NUBP1P53384 320 aa9.3□□□□□ -0.92
RNU6-272P-201ENST00000411028 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
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