Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI8

IGF2BP1, Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGF2BP1Q9NZI8 GARS-209ENST00000496643 772 ntTSL 25.29□□□□□ -1.563e-10■■■■■ 118.3
IGF2BP1Q9NZI8 TMEM183A-203ENST00000468449 763 ntTSL 311.95□□□□□ -0.53e-26■■■■■ 79.3
IGF2BP1Q9NZI8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.412e-25■■■■■ 77.6
IGF2BP1Q9NZI8 TMEM183A-204ENST00000488097 555 ntTSL 58.91□□□□□ -0.982e-25■■■■■ 77.6
IGF2BP1Q9NZI8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.071e-7■■■■■ 72
IGF2BP1Q9NZI8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.81e-7■■■■■ 72
IGF2BP1Q9NZI8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.11e-7■■■■■ 72
IGF2BP1Q9NZI8 RDX-211ENST00000530749 2558 ntTSL 221.81■■□□□ 1.081e-7■■■■■ 72
IGF2BP1Q9NZI8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.851e-7■■■■■ 72
IGF2BP1Q9NZI8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 72
IGF2BP1Q9NZI8 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 72
IGF2BP1Q9NZI8 RDX-203ENST00000527537 3403 ntTSL 1 (best)7.14□□□□□ -1.271e-7■■■■■ 72
IGF2BP1Q9NZI8 RDX-213ENST00000532461 3286 ntTSL 1 (best)5.78□□□□□ -1.481e-7■■■■■ 72
IGF2BP1Q9NZI8 GRINA-205ENST00000529301 1075 ntTSL 320.58■□□□□ 0.892e-17■■■■■ 69.4
IGF2BP1Q9NZI8 GRINA-203ENST00000525513 796 ntTSL 515.9■□□□□ 0.142e-17■■■■■ 69.4
IGF2BP1Q9NZI8 HMGCS1-207ENST00000514610 555 ntTSL 27.41□□□□□ -1.222e-10■■■■■ 66.5
IGF2BP1Q9NZI8 RFK-205ENST00000483155 962 ntTSL 211.6□□□□□ -0.556e-11■■■■■ 63
IGF2BP1Q9NZI8 BUB3-204ENST00000407911 895 ntTSL 1 (best)12.58□□□□□ -0.43e-7■■■■■ 60.8
IGF2BP1Q9NZI8 BUB3-205ENST00000481952 790 ntTSL 27.77□□□□□ -1.173e-7■■■■■ 60.8
IGF2BP1Q9NZI8 MKRN1-214ENST00000495305 1390 ntTSL 227.77■■■□□ 2.045e-20■■■■■ 60.7
IGF2BP1Q9NZI8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.715e-20■■■■■ 60.7
IGF2BP1Q9NZI8 MKRN1-215ENST00000496169 1625 ntTSL 223.01■■□□□ 1.275e-20■■■■■ 60.7
IGF2BP1Q9NZI8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.835e-20■■■■■ 60.7
IGF2BP1Q9NZI8 MKRN1-211ENST00000480552 906 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.865e-20■■■■■ 60.7
IGF2BP1Q9NZI8 MKRN1-205ENST00000468447 583 ntTSL 1 (best)9.35□□□□□ -0.915e-20■■■■■ 60.7
IGF2BP1Q9NZI8 HIRA-204ENST00000464189 560 ntTSL 410.78□□□□□ -0.682e-9■■■■■ 60
IGF2BP1Q9NZI8 GARS-208ENST00000485784 761 ntTSL 28.92□□□□□ -0.984e-10■■■■■ 59.9
IGF2BP1Q9NZI8 RPL39-202ENST00000468844 1915 ntTSL 1 (best)17.58■□□□□ 0.47e-28■■■■■ 59.5
IGF2BP1Q9NZI8 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.367e-28■■■■■ 59.5
IGF2BP1Q9NZI8 TFG-205ENST00000479672 776 ntTSL 323.14■■□□□ 1.295e-11■■■■■ 59.1
IGF2BP1Q9NZI8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.073e-10■■■■■ 59.1
IGF2BP1Q9NZI8 EIF1-204ENST00000469308 815 ntTSL 222.39■■□□□ 1.171e-12■■■■■ 58.9
IGF2BP1Q9NZI8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.547e-14■■■■■ 58
IGF2BP1Q9NZI8 SLC35F5-202ENST00000409106 3120 ntTSL 216.39■□□□□ 0.217e-14■■■■■ 58
IGF2BP1Q9NZI8 SLC35F5-209ENST00000469702 784 ntTSL 38.86□□□□□ -0.997e-14■■■■■ 58
IGF2BP1Q9NZI8 SLC35F5-204ENST00000420066 736 ntTSL 35.11□□□□□ -1.597e-14■■■■■ 58
IGF2BP1Q9NZI8 SLC26A5-215ENST00000487407 2098 ntTSL 224.3■■□□□ 1.485e-14■■■■■ 57.9
IGF2BP1Q9NZI8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.035e-14■■■■■ 57.9
IGF2BP1Q9NZI8 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.165e-14■■■■■ 57.9
IGF2BP1Q9NZI8 SLC26A5-203ENST00000354356 2686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.395e-14■■■■■ 57.9
IGF2BP1Q9NZI8 SLC26A5-201ENST00000306312 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.425e-14■■■■■ 57.9
IGF2BP1Q9NZI8 SLC26A5-204ENST00000356767 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.485e-14■■■■■ 57.9
IGF2BP1Q9NZI8 SLC26A5-211ENST00000432958 2588 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.515e-14■■■■■ 57.9
IGF2BP1Q9NZI8 SLC26A5-212ENST00000445809 2324 ntTSL 29.59□□□□□ -0.875e-14■■■■■ 57.9
IGF2BP1Q9NZI8 SLC26A5-213ENST00000454864 2242 ntTSL 28.07□□□□□ -1.125e-14■■■■■ 57.9
IGF2BP1Q9NZI8 SLC26A5-210ENST00000423416 2374 ntTSL 27.48□□□□□ -1.215e-14■■■■■ 57.9
IGF2BP1Q9NZI8 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.375e-14■■■■■ 57.9
IGF2BP1Q9NZI8 SLC26A5-214ENST00000456463 2370 ntTSL 56.42□□□□□ -1.385e-14■■■■■ 57.9
IGF2BP1Q9NZI8 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.435e-14■■■■■ 57.9
IGF2BP1Q9NZI8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.582e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.552e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.392e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.312e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 MUC1-220ENST00000498431 667 ntTSL 1 (best)15.6■□□□□ 0.092e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.092e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -02e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.042e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.082e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 MUC1-214ENST00000462317 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.41□□□□□ -0.12e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.112e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.172e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.192e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 MUC1-222ENST00000610468 1162 ntTSL 1 (best)13.62□□□□□ -0.232e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.232e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.322e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.322e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.322e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 MUC1-216ENST00000467134 619 ntTSL 1 (best)11.08□□□□□ -0.642e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 GART-203ENST00000381815 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.742e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 GART-201ENST00000361093 2149 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.092e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 GART-213ENST00000467575 922 ntTSL 38.24□□□□□ -1.092e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 MUC1-205ENST00000368389 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.132e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 MUC1-206ENST00000368390 804 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.132e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 MUC1-209ENST00000368396 516 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.132e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 MUC1-210ENST00000368398 729 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.132e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 GART-206ENST00000424203 3571 ntTSL 1 (best)7.76□□□□□ -1.172e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.252e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.372e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.372e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.512e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 GART-211ENST00000460305 389 ntTSL 1 (best)4.63□□□□□ -1.672e-17■■■■■ 57.6
IGF2BP1Q9NZI8 HMGCS1-205ENST00000508319 591 ntTSL 312.76□□□□□ -0.373e-10■■■■■ 57.5
IGF2BP1Q9NZI8 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.077e-14■■■■■ 56.9
IGF2BP1Q9NZI8 ASAH1-250ENST00000637536 562 ntTSL 421.88■■□□□ 1.093e-9■■■■■ 56.3
IGF2BP1Q9NZI8 ASAH1-266ENST00000637946 913 ntTSL 518.58■□□□□ 0.563e-9■■■■■ 56.3
IGF2BP1Q9NZI8 ASNS-204ENST00000414884 584 ntTSL 218.48■□□□□ 0.556e-9■■■■■ 56.1
IGF2BP1Q9NZI8 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.382e-18■■■■■ 55.8
IGF2BP1Q9NZI8 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.552e-18■■■■■ 55.8
IGF2BP1Q9NZI8 GYPE-203ENST00000506264 1624 ntTSL 55.34□□□□□ -1.552e-18■■■■■ 55.8
IGF2BP1Q9NZI8 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.65□□□□□ -1.832e-18■■■■■ 55.8
IGF2BP1Q9NZI8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.341e-7■■■■■ 55.7
IGF2BP1Q9NZI8 ADIPOR1-205ENST00000495562 2109 ntTSL 29.74□□□□□ -0.857e-9■■■■■ 55.7
IGF2BP1Q9NZI8 SERPING1-207ENST00000457869 569 ntTSL 422.88■■□□□ 1.251e-16■■■■■ 55.5
IGF2BP1Q9NZI8 SERPING1-206ENST00000405496 648 ntTSL 412.85□□□□□ -0.351e-16■■■■■ 55.5
IGF2BP1Q9NZI8 SERPING1-213ENST00000619430 634 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.351e-16■■■■■ 55.5
IGF2BP1Q9NZI8 SERPING1-210ENST00000531133 1004 ntTSL 1 (best)8.82□□□□□ -11e-16■■■■■ 55.5
IGF2BP1Q9NZI8 GRINA-210ENST00000534791 1050 ntTSL 510.36□□□□□ -0.756e-7■■■■■ 54.1
IGF2BP1Q9NZI8 GRINA-208ENST00000533044 564 ntTSL 39.27□□□□□ -0.936e-7■■■■■ 54.1
IGF2BP1Q9NZI8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.238e-12■■■■■ 53.9
IGF2BP1Q9NZI8 COPZ1-216ENST00000552848 537 ntTSL 59.86□□□□□ -0.832e-17■■■■■ 53.6
Retrieved 100 of 17,531 protein–RNA pairs in 354.7 ms