RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253339.9

LATS1-201, Transcript of large tumor suppressor kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LATS1, Length 4,256 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATS1-201ENST00000253339 CHIC1Q5VXU3 224 aa9.1□□□□□ -0.95
LATS1-201ENST00000253339 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LATS1-201ENST00000253339 EHMT2Q96KQ7 1210 aa8.19□□□□□ -1.1
LATS1-201ENST00000253339 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
LATS1-201ENST00000253339 PLPPR3Q6T4P5 718 aa7.79□□□□□ -1.16
LATS1-201ENST00000253339 SLC24A1O60721 1099 aa7.74□□□□□ -1.17
LATS1-201ENST00000253339 KCNA4P22459 653 aa7.58□□□□□ -1.2
LATS1-201ENST00000253339 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
LATS1-201ENST00000253339 CSRNP3Q8WYN3 585 aa7.38□□□□□ -1.23
LATS1-201ENST00000253339 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LATS1-201ENST00000253339 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
LATS1-201ENST00000253339 ADRA2BP18089 450 aa7.33□□□□□ -1.24
LATS1-201ENST00000253339 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
LATS1-201ENST00000253339 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
LATS1-201ENST00000253339 PPP6R1Q9UPN7 881 aa7□□□□□ -1.29
LATS1-201ENST00000253339 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa6.98□□□□□ -1.29
LATS1-201ENST00000253339 DCAF8L2P0C7V8 631 aa6.97□□□□□ -1.29
LATS1-201ENST00000253339 FKBP8Q14318 412 aa6.89□□□□□ -1.31
LATS1-201ENST00000253339 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
LATS1-201ENST00000253339 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
LATS1-201ENST00000253339 ZBTB22O15209 634 aa6.84□□□□□ -1.32
LATS1-201ENST00000253339 NPM3O75607 178 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
LATS1-201ENST00000253339 BCANQ96GW7 911 aa6.76□□□□□ -1.33
LATS1-201ENST00000253339 FOXD4L1Q9NU39 408 aa6.75□□□□□ -1.33
LATS1-201ENST00000253339 FOXD1Q16676 465 aa6.74□□□□□ -1.33
LATS1-201ENST00000253339 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.73□□□□□ -1.33
LATS1-201ENST00000253339 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
LATS1-201ENST00000253339 TAOK2Q9UL54 1235 aa6.67□□□□□ -1.34
LATS1-201ENST00000253339 PLCB2Q00722 1185 aa6.66□□□□□ -1.34
LATS1-201ENST00000253339 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
LATS1-201ENST00000253339 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
LATS1-201ENST00000253339 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa6.56□□□□□ -1.36
LATS1-201ENST00000253339 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LATS1-201ENST00000253339 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
LATS1-201ENST00000253339 CFAP44Q96MT7 982 aa6.5□□□□□ -1.37
LATS1-201ENST00000253339 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.5□□□□□ -1.37
LATS1-201ENST00000253339 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
LATS1-201ENST00000253339 NBR1Q14596 966 aa6.45□□□□□ -1.38
LATS1-201ENST00000253339 VSIG10Q8N0Z9 540 aa6.44□□□□□ -1.38
LATS1-201ENST00000253339 ARXQ96QS3 562 aa6.44□□□□□ -1.38
LATS1-201ENST00000253339 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
LATS1-201ENST00000253339 HOMEZQ8IX15 550 aa6.43□□□□□ -1.38
LATS1-201ENST00000253339 C14orf37Q86TY3 774 aa6.42□□□□□ -1.38
LATS1-201ENST00000253339 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa6.42□□□□□ -1.38
LATS1-201ENST00000253339 FBLN2P98095 1184 aa6.36□□□□□ -1.39
LATS1-201ENST00000253339 FBXO3Q9UK99 471 aa6.36□□□□□ -1.39
LATS1-201ENST00000253339 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.33□□□□□ -1.4
LATS1-201ENST00000253339 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.33□□□□□ -1.4
LATS1-201ENST00000253339 KLHL34Q8N239 644 aa6.32□□□□□ -1.4
LATS1-201ENST00000253339 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
LATS1-201ENST00000253339 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
LATS1-201ENST00000253339 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
LATS1-201ENST00000253339 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa6.29□□□□□ -1.4
LATS1-201ENST00000253339 ATXN8OSP0DMR3 200 aa6.26□□□□□ -1.41
LATS1-201ENST00000253339 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa6.24□□□□□ -1.41
LATS1-201ENST00000253339 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa6.23□□□□□ -1.41
LATS1-201ENST00000253339 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
LATS1-201ENST00000253339 VASPP50552 380 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
LATS1-201ENST00000253339 DCAF8L1A6NGE4 600 aa6.22□□□□□ -1.41
LATS1-201ENST00000253339 SLC4A2P04920 1241 aa6.2□□□□□ -1.42
LATS1-201ENST00000253339 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
LATS1-201ENST00000253339 TMEM132AQ24JP5 1023 aa6.19□□□□□ -1.42
LATS1-201ENST00000253339 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
LATS1-201ENST00000253339 SPDYE4A6NLX3 237 aa6.17□□□□□ -1.42
LATS1-201ENST00000253339 CHGAP10645 457 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
LATS1-201ENST00000253339 ARID3AQ99856 593 aa6.13□□□□□ -1.43
LATS1-201ENST00000253339 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
LATS1-201ENST00000253339 PKD2Q13563 968 aa6.11□□□□□ -1.43
LATS1-201ENST00000253339 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
LATS1-201ENST00000253339 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP6.11□□□□□ -1.43
LATS1-201ENST00000253339 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
LATS1-201ENST00000253339 PLCD3Q8N3E9 789 aa6.08□□□□□ -1.44
LATS1-201ENST00000253339 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
LATS1-201ENST00000253339 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP6.08□□□□□ -1.44
LATS1-201ENST00000253339 SPOCK2Q92563 424 aa6.04□□□□□ -1.44
LATS1-201ENST00000253339 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
LATS1-201ENST00000253339 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
LATS1-201ENST00000253339 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
LATS1-201ENST00000253339 RGL2O15211 777 aa6.02□□□□□ -1.45
LATS1-201ENST00000253339 NEUROD2Q15784 382 aa6.01□□□□□ -1.45
LATS1-201ENST00000253339 UBTFP17480 764 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
LATS1-201ENST00000253339 MSH5O43196 834 aa5.98□□□□□ -1.45
LATS1-201ENST00000253339 MIER1Q8N108 512 aa5.97□□□□□ -1.45
LATS1-201ENST00000253339 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
LATS1-201ENST00000253339 DNAJC5BQ9UF47 199 aa5.96□□□□□ -1.45
LATS1-201ENST00000253339 TRIM41Q8WV44 630 aa5.96□□□□□ -1.46
LATS1-201ENST00000253339 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
LATS1-201ENST00000253339 PLEKHG5O94827 1062 aa5.92□□□□□ -1.46
LATS1-201ENST00000253339 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
LATS1-201ENST00000253339 WDR70Q9NW82 654 aa5.92□□□□□ -1.46
LATS1-201ENST00000253339 ZBTB7CA1YPR0 619 aa5.9□□□□□ -1.46
LATS1-201ENST00000253339 TRHP20396 242 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
LATS1-201ENST00000253339 LMOD2Q6P5Q4 547 aa5.88□□□□□ -1.47
LATS1-201ENST00000253339 MYT1LQ9UL68 1186 aa5.88□□□□□ -1.47
LATS1-201ENST00000253339 DMRT2Q9Y5R5 561 aa5.88□□□□□ -1.47
LATS1-201ENST00000253339 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
LATS1-201ENST00000253339 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
LATS1-201ENST00000253339 STK25O00506 426 aa5.84□□□□□ -1.47
LATS1-201ENST00000253339 APLP2Q06481 763 aa5.84□□□□□ -1.47
LATS1-201ENST00000253339 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.6 ms