RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000214542.1

Cadm1-210, Transcript of Cell adhesion molecule 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cadm1, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa54.39■■■■■ 6.3
Cadm1-210ENSMUST00000214542 NischQ80TM9 1593 aa53.32■■■■■ 6.13
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Abcc9P70170 1546 aa51.95■■■■■ 5.91
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Abcc8B2RUS7 1588 aa51.85■■■■■ 5.89
Cadm1-210ENSMUST00000214542 ScribQ80U72 1612 aa50.68■■■■■ 5.7
Cadm1-210ENSMUST00000214542 NacadQ5SWP3 1504 aa48.82■■■■■ 5.41
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Kdm5dQ62240 1548 aa48.72■■■■■ 5.39
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa47.96■■■■■ 5.27
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Sycp2Q9CUU3 1500 aa47.95■■■■■ 5.27
Cadm1-210ENSMUST00000214542 BicraF8VPZ9 1578 aa47.54■■■■■ 5.2
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Dcaf1Q80TR8 1506 aa47.38■■■■■ 5.18
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa46.39■■■■■ 5.02
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP46.35■■■■■ 5.01
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP46.28■■■■■ 5
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP45.65■■■■■ 4.9
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa45.63■■■■■ 4.89
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Baz1aO88379 1555 aa45.6■■■■■ 4.89
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Crybg2B7ZCC2 1516 aa45.47■■■■■ 4.87
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Ccdc180J3QNE4 1664 aa45.31■■■■■ 4.84
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Ercc6F8VPZ5 1481 aa45.29■■■■■ 4.84
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP45.23■■■■■ 4.83
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Rhox8Q6VSS7 320 aa45.2■■■■■ 4.83
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Smarca2Q6DIC0 1577 aa45.07■■■■■ 4.81
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Fam135aQ6NS59 1506 aa45.04■■■■■ 4.8
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP44.9■■■■■ 4.78
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa44.84■■■■■ 4.77
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa44.63■■■■■ 4.73
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Wdr62Q3U3T8 1523 aa44.6■■■■■ 4.73
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Frmpd1A2AKB4 1549 aa44.59■■■■■ 4.73
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP44.51■■■■■ 4.72
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Ubl4bQ9CQ84 188 aa44.27■■■■■ 4.68
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Dnajc5P60904 198 aa44.25■■■■■ 4.67
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Baz1bQ9Z277 1479 aa44.23■■■■■ 4.67
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Unc13aQ4KUS2 1712 aa44.02■■■■■ 4.64
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Mrc2Q64449 1479 aa44.01■■■■■ 4.64
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Trim41Q5NCC3 630 aa43.95■■■■■ 4.63
Cadm1-210ENSMUST00000214542 CftrP26361 1476 aa43.3■■■■■ 4.52
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa43.23■■■■■ 4.51
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa43.21■■■■■ 4.51
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Synj1Q8CHC4 1574 aa43.17■■■■■ 4.5
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP42.92■■■■■ 4.46
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Cux2P70298 1426 aa42.87■■■■■ 4.45
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP42.81■■■■■ 4.44
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Kif21aQ9QXL2 1672 aa42.81■■■■■ 4.44
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Kif15Q6P9L6 1387 aa42.67■■■■■ 4.42
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Rtl1Q7M732 1744 aa42.57■■■■■ 4.41
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa42.56■■■■■ 4.4
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Shroom2A2ALU4 1481 aa42.53■■■■■ 4.4
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP42.5■■■■■ 4.39
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP42.34■■■■■ 4.37
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Col17a1Q07563 1470 aa42.24■■■■■ 4.35
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Lamc3Q9R0B6 1581 aa42.24■■■■■ 4.35
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP42.09■■■■■ 4.33
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Cep164Q5DU05 1446 aa42.05■■■■■ 4.32
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Plb1Q3TTY0 1478 aa41.98■■■■■ 4.31
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Top2bQ64511 1612 aa41.91■■■■■ 4.3
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.3
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Il27Q8K3I6 234 aa41.8■■■■■ 4.28
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Crocc2F6XLV1 1638 aa41.64■■■■■ 4.26
Cadm1-210ENSMUST00000214542 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Ccdc18Q640L5 1455 aa41.6■■■■■ 4.25
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Rusc2Q80U22 1514 aa41.53■■■■■ 4.24
Cadm1-210ENSMUST00000214542 TnnQ80Z71 1560 aa41.46■■■■■ 4.23
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Ift140E9PY46 1464 aa41.42■■■■■ 4.22
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Camsap1A2AHC3 1581 aa41.41■■■■■ 4.22
Cadm1-210ENSMUST00000214542 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa41.24■■■■■ 4.19
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Duox2A2AQ99 1517 aa41.08■■■■■ 4.17
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Disp1Q3TDN0 1521 aa41.08■■■■■ 4.17
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Setd1bQ8CFT2 1985 aa41.03■■■■■ 4.16
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Cngb1E1AZ71 1325 aa41.01■■■■■ 4.16
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Golga3P55937 1487 aa41.01■■■■■ 4.16
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Adgrl3Q80TS3 1537 aa40.94■■■■■ 4.14
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa40.93■■■■■ 4.14
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa40.87■■■■■ 4.13
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa40.81■■■■■ 4.12
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Samd9lQ69Z37 1561 aa40.78■■■■■ 4.12
Cadm1-210ENSMUST00000214542 PtprkP35822 1457 aa40.78■■■■■ 4.12
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Grin2bQ01097 1482 aa40.74■■■■■ 4.11
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Cep170Q6A065 1588 aa40.74■■■■■ 4.11
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Gm156Q58A37 223 aa40.73■■■■■ 4.11
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Fmn1Q05860 1466 aa40.71■■■■■ 4.11
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa40.66■■■■■ 4.1
Cadm1-210ENSMUST00000214542 PtprtQ99M80 1454 aa40.63■■■■■ 4.09
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Fgd6Q69ZL1 1399 aa40.6■■■■■ 4.09
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Rad54l2Q99NG0 1466 aa40.59■■■■■ 4.09
Cadm1-210ENSMUST00000214542 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.07
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Efcab5A0JP43 1406 aa40.47■■■■■ 4.07
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Grin2aP35436 1464 aa40.46■■■■■ 4.07
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Magi3Q9EQJ9 1476 aa40.43■■■■■ 4.06
Cadm1-210ENSMUST00000214542 AknaQ80VW7 1404 aa40.37■■■■■ 4.05
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Abcc1O35379 1528 aa40.32■■■■■ 4.04
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Pprc1Q6NZN1 1644 aa40.3■■■■■ 4.04
Cadm1-210ENSMUST00000214542 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.5 ms