RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000185218.1

Gm28417-201, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Gm28417, Length 785 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa48.4■■■■■ 5.34
Gm28417-201ENSMUST00000185218 NischQ80TM9 1593 aa47.66■■■■■ 5.22
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Abcc8B2RUS7 1588 aa46.22■■■■■ 4.99
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Abcc9P70170 1546 aa45.98■■■■■ 4.95
Gm28417-201ENSMUST00000185218 ScribQ80U72 1612 aa44.84■■■■■ 4.77
Gm28417-201ENSMUST00000185218 NacadQ5SWP3 1504 aa43.45■■■■■ 4.55
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Kdm5dQ62240 1548 aa43.27■■■■■ 4.52
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Sycp2Q9CUU3 1500 aa42.61■■■■■ 4.41
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Dcaf1Q80TR8 1506 aa42.3■■■■■ 4.36
Gm28417-201ENSMUST00000185218 BicraF8VPZ9 1578 aa42.09■■■■■ 4.33
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa41.95■■■■■ 4.31
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa41.48■■■■■ 4.23
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Rhox8Q6VSS7 320 aa40.88■■■■■ 4.13
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP40.87■■■■■ 4.13
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Baz1aO88379 1555 aa40.83■■■■■ 4.13
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Crybg2B7ZCC2 1516 aa40.79■■■■■ 4.12
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Ccdc180J3QNE4 1664 aa40.66■■■■■ 4.1
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP40.58■■■■■ 4.09
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa40.27■■■■■ 4.04
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Ercc6F8VPZ5 1481 aa40.23■■■■■ 4.03
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Smarca2Q6DIC0 1577 aa40.06■■■■■ 4
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa39.86■■■■□ 3.97
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Fam135aQ6NS59 1506 aa39.84■■■■□ 3.97
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa39.76■■■■□ 3.96
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Wdr62Q3U3T8 1523 aa39.6■■■■□ 3.93
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Frmpd1A2AKB4 1549 aa39.59■■■■□ 3.93
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP39.58■■■■□ 3.93
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Ubl4bQ9CQ84 188 aa39.37■■■■□ 3.89
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Baz1bQ9Z277 1479 aa39.36■■■■□ 3.89
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Mrc2Q64449 1479 aa38.99■■■■□ 3.83
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Unc13aQ4KUS2 1712 aa38.94■■■■□ 3.82
Gm28417-201ENSMUST00000185218 CftrP26361 1476 aa38.73■■■■□ 3.79
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa38.65■■■■□ 3.78
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Synj1Q8CHC4 1574 aa38.58■■■■□ 3.77
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Dnajc5P60904 198 aa38.55■■■■□ 3.76
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Trim41Q5NCC3 630 aa38.52■■■■□ 3.76
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP38.52■■■■□ 3.76
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Rtl1Q7M732 1744 aa38.43■■■■□ 3.74
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa38.37■■■■□ 3.73
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP38.27■■■■□ 3.72
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Cux2P70298 1426 aa38.16■■■■□ 3.7
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa38.14■■■■□ 3.7
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Kif15Q6P9L6 1387 aa38.08■■■■□ 3.69
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP38.08■■■■□ 3.69
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Kif21aQ9QXL2 1672 aa37.9■■■■□ 3.66
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP37.86■■■■□ 3.65
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Lamc3Q9R0B6 1581 aa37.7■■■■□ 3.63
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Cep164Q5DU05 1446 aa37.57■■■■□ 3.6
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP37.57■■■■□ 3.6
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Shroom2A2ALU4 1481 aa37.46■■■■□ 3.59
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Il27Q8K3I6 234 aa37.36■■■■□ 3.57
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP37.3■■■■□ 3.56
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Plb1Q3TTY0 1478 aa37.28■■■■□ 3.56
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Ccdc18Q640L5 1455 aa37.26■■■■□ 3.55
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
Gm28417-201ENSMUST00000185218 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Col17a1Q07563 1470 aa37.1■■■■□ 3.53
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Crocc2F6XLV1 1638 aa37.06■■■■□ 3.52
Gm28417-201ENSMUST00000185218 TnnQ80Z71 1560 aa37.05■■■■□ 3.52
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Top2bQ64511 1612 aa36.99■■■■□ 3.51
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Cngb1E1AZ71 1325 aa36.98■■■■□ 3.51
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Camsap1A2AHC3 1581 aa36.96■■■■□ 3.51
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP36.94■■■■□ 3.5
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Golga3P55937 1487 aa36.94■■■■□ 3.5
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Ift140E9PY46 1464 aa36.9■■■■□ 3.5
Gm28417-201ENSMUST00000185218 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Rusc2Q80U22 1514 aa36.83■■■■□ 3.49
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Duox2A2AQ99 1517 aa36.68■■■■□ 3.46
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Fmn1Q05860 1466 aa36.62■■■■□ 3.45
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Disp1Q3TDN0 1521 aa36.55■■■■□ 3.44
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Grin2bQ01097 1482 aa36.44■■■■□ 3.42
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa36.41■■■■□ 3.42
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP36.36■■■■□ 3.41
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Samd9lQ69Z37 1561 aa36.29■■■■□ 3.4
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Efcab5A0JP43 1406 aa36.29■■■■□ 3.4
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Setd1bQ8CFT2 1985 aa36.29■■■■□ 3.4
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Rad54l2Q99NG0 1466 aa36.17■■■■□ 3.38
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Adgrl3Q80TS3 1537 aa36.16■■■■□ 3.38
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Fgd6Q69ZL1 1399 aa36.15■■■■□ 3.38
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa36.13■■■■□ 3.37
Gm28417-201ENSMUST00000185218 PtprkP35822 1457 aa36.12■■■■□ 3.37
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa36.1■■■■□ 3.37
Gm28417-201ENSMUST00000185218 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Grin2aP35436 1464 aa36.07■■■■□ 3.37
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Gm156Q58A37 223 aa36.05■■■■□ 3.36
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa36.04■■■■□ 3.36
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa36.01■■■■□ 3.36
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Magi3Q9EQJ9 1476 aa36■■■■□ 3.35
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Cep170Q6A065 1588 aa36■■■■□ 3.35
Gm28417-201ENSMUST00000185218 AknaQ80VW7 1404 aa35.91■■■■□ 3.34
Gm28417-201ENSMUST00000185218 NrkQ9R0G8 1455 aa35.9■■■■□ 3.34
Gm28417-201ENSMUST00000185218 PtprtQ99M80 1454 aa35.86■■■■□ 3.33
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa35.8■■■■□ 3.32
Gm28417-201ENSMUST00000185218 Abcc1O35379 1528 aa35.79■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 44.1 ms