RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000173680.1

Gm20481-201, Transcript of Predicted gene 20481 (Fragment), mousemouse

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene Gm20481, Length 564 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa35.88■■■■□ 3.33
Gm20481-201ENSMUST00000173680 NischQ80TM9 1593 aa35■■■■□ 3.19
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Abcc9P70170 1546 aa34.28■■■■□ 3.08
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Abcc8B2RUS7 1588 aa34.15■■■■□ 3.06
Gm20481-201ENSMUST00000173680 ScribQ80U72 1612 aa33.5■■■□□ 2.95
Gm20481-201ENSMUST00000173680 NacadQ5SWP3 1504 aa32.2■■■□□ 2.74
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Kdm5dQ62240 1548 aa32.13■■■□□ 2.73
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa31.89■■■□□ 2.7
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Sycp2Q9CUU3 1500 aa31.66■■■□□ 2.66
Gm20481-201ENSMUST00000173680 BicraF8VPZ9 1578 aa31.44■■■□□ 2.62
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Dcaf1Q80TR8 1506 aa31.24■■■□□ 2.59
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa30.42■■■□□ 2.46
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa30.16■■■□□ 2.42
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Crybg2B7ZCC2 1516 aa29.94■■■□□ 2.38
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Baz1aO88379 1555 aa29.93■■■□□ 2.38
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Ercc6F8VPZ5 1481 aa29.85■■■□□ 2.37
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Fam135aQ6NS59 1506 aa29.85■■■□□ 2.37
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Smarca2Q6DIC0 1577 aa29.73■■■□□ 2.35
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Ccdc180J3QNE4 1664 aa29.72■■■□□ 2.35
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Dnajc5P60904 198 aa29.56■■■□□ 2.32
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa29.54■■■□□ 2.32
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Wdr62Q3U3T8 1523 aa29.45■■■□□ 2.31
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Frmpd1A2AKB4 1549 aa29.44■■■□□ 2.3
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Rhox8Q6VSS7 320 aa29.4■■■□□ 2.3
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.29
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Baz1bQ9Z277 1479 aa29.36■■■□□ 2.29
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa29.35■■■□□ 2.29
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Ubl4bQ9CQ84 188 aa29.12■■■□□ 2.25
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Mrc2Q64449 1479 aa29.1■■■□□ 2.25
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Trim41Q5NCC3 630 aa29.04■■■□□ 2.24
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Unc13aQ4KUS2 1712 aa28.97■■■□□ 2.23
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa28.54■■■□□ 2.16
Gm20481-201ENSMUST00000173680 CftrP26361 1476 aa28.46■■■□□ 2.15
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa28.36■■■□□ 2.13
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Synj1Q8CHC4 1574 aa28.31■■■□□ 2.12
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Shroom2A2ALU4 1481 aa28.28■■■□□ 2.12
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Cux2P70298 1426 aa28.22■■■□□ 2.11
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Kif21aQ9QXL2 1672 aa28.2■■■□□ 2.11
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Col17a1Q07563 1470 aa28.09■■■□□ 2.09
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Kif15Q6P9L6 1387 aa28.02■■■□□ 2.08
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Lamc3Q9R0B6 1581 aa27.79■■■□□ 2.04
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Rtl1Q7M732 1744 aa27.72■■■□□ 2.03
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Top2bQ64511 1612 aa27.71■■■□□ 2.03
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa27.67■■■□□ 2.02
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Plb1Q3TTY0 1478 aa27.67■■■□□ 2.02
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Cep164Q5DU05 1446 aa27.63■■■□□ 2.01
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Rusc2Q80U22 1514 aa27.43■■□□□ 1.98
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Crocc2F6XLV1 1638 aa27.38■■□□□ 1.97
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa27.37■■□□□ 1.97
Gm20481-201ENSMUST00000173680 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Ift140E9PY46 1464 aa27.31■■□□□ 1.96
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Ccdc18Q640L5 1455 aa27.28■■□□□ 1.96
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Il27Q8K3I6 234 aa27.28■■□□□ 1.96
Gm20481-201ENSMUST00000173680 TnnQ80Z71 1560 aa27.26■■□□□ 1.95
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Camsap1A2AHC3 1581 aa27.2■■□□□ 1.94
Gm20481-201ENSMUST00000173680 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa27.14■■□□□ 1.94
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Adgrl3Q80TS3 1537 aa27.1■■□□□ 1.93
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Disp1Q3TDN0 1521 aa27.08■■□□□ 1.93
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Duox2A2AQ99 1517 aa27■■□□□ 1.91
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
Gm20481-201ENSMUST00000173680 PtprkP35822 1457 aa26.93■■□□□ 1.9
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Setd1bQ8CFT2 1985 aa26.93■■□□□ 1.9
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Golga3P55937 1487 aa26.93■■□□□ 1.9
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Cep170Q6A065 1588 aa26.92■■□□□ 1.9
Gm20481-201ENSMUST00000173680 PtprtQ99M80 1454 aa26.92■■□□□ 1.9
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Gm156Q58A37 223 aa26.91■■□□□ 1.9
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa26.9■■□□□ 1.9
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa26.87■■□□□ 1.89
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa26.86■■□□□ 1.89
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Samd9lQ69Z37 1561 aa26.83■■□□□ 1.89
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Grin2bQ01097 1482 aa26.75■■□□□ 1.87
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Fgd6Q69ZL1 1399 aa26.75■■□□□ 1.87
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Pprc1Q6NZN1 1644 aa26.72■■□□□ 1.87
Gm20481-201ENSMUST00000173680 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Cngb1E1AZ71 1325 aa26.65■■□□□ 1.86
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Rad54l2Q99NG0 1466 aa26.65■■□□□ 1.86
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Fmn1Q05860 1466 aa26.64■■□□□ 1.86
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Magi3Q9EQJ9 1476 aa26.63■■□□□ 1.85
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Grin2aP35436 1464 aa26.62■■□□□ 1.85
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Efcab5A0JP43 1406 aa26.59■■□□□ 1.85
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Abcc1O35379 1528 aa26.58■■□□□ 1.85
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa26.57■■□□□ 1.84
Gm20481-201ENSMUST00000173680 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.5 ms