RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000167546.1

Usf1-210, Transcript of Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Usf1, Length 1,822 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1-210ENSMUST00000167546 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa49.61■■■■■ 5.53
Usf1-210ENSMUST00000167546 NischQ80TM9 1593 aa49.19■■■■■ 5.46
Usf1-210ENSMUST00000167546 Abcc9P70170 1546 aa47.63■■■■■ 5.21
Usf1-210ENSMUST00000167546 Abcc8B2RUS7 1588 aa47.41■■■■■ 5.18
Usf1-210ENSMUST00000167546 ScribQ80U72 1612 aa45.45■■■■■ 4.87
Usf1-210ENSMUST00000167546 NacadQ5SWP3 1504 aa44.1■■■■■ 4.65
Usf1-210ENSMUST00000167546 Kdm5dQ62240 1548 aa44.07■■■■■ 4.65
Usf1-210ENSMUST00000167546 Dcaf1Q80TR8 1506 aa43.77■■■■■ 4.6
Usf1-210ENSMUST00000167546 Sycp2Q9CUU3 1500 aa43.21■■■■■ 4.51
Usf1-210ENSMUST00000167546 Rhox8Q6VSS7 320 aa42.97■■■■■ 4.47
Usf1-210ENSMUST00000167546 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa42.91■■■■■ 4.46
Usf1-210ENSMUST00000167546 BicraF8VPZ9 1578 aa42.52■■■■■ 4.4
Usf1-210ENSMUST00000167546 Ccdc180J3QNE4 1664 aa42.37■■■■■ 4.37
Usf1-210ENSMUST00000167546 Baz1aO88379 1555 aa42.33■■■■■ 4.37
Usf1-210ENSMUST00000167546 Crybg2B7ZCC2 1516 aa42.11■■■■■ 4.33
Usf1-210ENSMUST00000167546 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
Usf1-210ENSMUST00000167546 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
Usf1-210ENSMUST00000167546 Smarca2Q6DIC0 1577 aa41.13■■■■■ 4.18
Usf1-210ENSMUST00000167546 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
Usf1-210ENSMUST00000167546 Rtl1Q7M732 1744 aa40.88■■■■■ 4.14
Usf1-210ENSMUST00000167546 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa40.82■■■■■ 4.12
Usf1-210ENSMUST00000167546 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
Usf1-210ENSMUST00000167546 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
Usf1-210ENSMUST00000167546 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa40.7■■■■■ 4.11
Usf1-210ENSMUST00000167546 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa40.53■■■■■ 4.08
Usf1-210ENSMUST00000167546 Ercc6F8VPZ5 1481 aa40.43■■■■■ 4.06
Usf1-210ENSMUST00000167546 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa40.14■■■■■ 4.02
Usf1-210ENSMUST00000167546 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa40.13■■■■■ 4.01
Usf1-210ENSMUST00000167546 Wdr62Q3U3T8 1523 aa40.1■■■■■ 4.01
Usf1-210ENSMUST00000167546 Frmpd1A2AKB4 1549 aa40.05■■■■■ 4
Usf1-210ENSMUST00000167546 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP40.03■■■■■ 4
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Usf1-210ENSMUST00000167546 Synj1Q8CHC4 1574 aa39.95■■■■□ 3.99
Usf1-210ENSMUST00000167546 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa39.94■■■■□ 3.98
Usf1-210ENSMUST00000167546 Fam135aQ6NS59 1506 aa39.91■■■■□ 3.98
Usf1-210ENSMUST00000167546 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
Usf1-210ENSMUST00000167546 Trim41Q5NCC3 630 aa39.57■■■■□ 3.93
Usf1-210ENSMUST00000167546 Unc13aQ4KUS2 1712 aa39.51■■■■□ 3.92
Usf1-210ENSMUST00000167546 Baz1bQ9Z277 1479 aa39.47■■■■□ 3.91
Usf1-210ENSMUST00000167546 Ubl4bQ9CQ84 188 aa39.38■■■■□ 3.89
Usf1-210ENSMUST00000167546 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP39.37■■■■□ 3.89
Usf1-210ENSMUST00000167546 Mrc2Q64449 1479 aa39■■■■□ 3.83
Usf1-210ENSMUST00000167546 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP38.9■■■■□ 3.82
Usf1-210ENSMUST00000167546 Kif15Q6P9L6 1387 aa38.79■■■■□ 3.8
Usf1-210ENSMUST00000167546 Golga3P55937 1487 aa38.77■■■■□ 3.8
Usf1-210ENSMUST00000167546 Lamc3Q9R0B6 1581 aa38.72■■■■□ 3.79
Usf1-210ENSMUST00000167546 Cux2P70298 1426 aa38.66■■■■□ 3.78
Usf1-210ENSMUST00000167546 Top2bQ64511 1612 aa38.66■■■■□ 3.78
Usf1-210ENSMUST00000167546 Cngb1E1AZ71 1325 aa38.64■■■■□ 3.78
Usf1-210ENSMUST00000167546 TnnQ80Z71 1560 aa38.41■■■■□ 3.74
Usf1-210ENSMUST00000167546 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP38.32■■■■□ 3.72
Usf1-210ENSMUST00000167546 Fmn1Q05860 1466 aa38.25■■■■□ 3.71
Usf1-210ENSMUST00000167546 Kif21aQ9QXL2 1672 aa38.25■■■■□ 3.71
Usf1-210ENSMUST00000167546 Cep164Q5DU05 1446 aa38.21■■■■□ 3.71
Usf1-210ENSMUST00000167546 Ccdc18Q640L5 1455 aa38.18■■■■□ 3.7
Usf1-210ENSMUST00000167546 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa38.11■■■■□ 3.69
Usf1-210ENSMUST00000167546 Camsap1A2AHC3 1581 aa38.08■■■■□ 3.69
Usf1-210ENSMUST00000167546 Il27Q8K3I6 234 aa38.08■■■■□ 3.69
Usf1-210ENSMUST00000167546 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP37.9■■■■□ 3.66
Usf1-210ENSMUST00000167546 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP37.88■■■■□ 3.65
Usf1-210ENSMUST00000167546 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa37.83■■■■□ 3.65
Usf1-210ENSMUST00000167546 Crocc2F6XLV1 1638 aa37.71■■■■□ 3.63
Usf1-210ENSMUST00000167546 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP37.71■■■■□ 3.63
Usf1-210ENSMUST00000167546 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP37.68■■■■□ 3.62
Usf1-210ENSMUST00000167546 Plb1Q3TTY0 1478 aa37.66■■■■□ 3.62
Usf1-210ENSMUST00000167546 Chic1Q8CBW7 227 aa37.63■■■■□ 3.61
Usf1-210ENSMUST00000167546 Grin2bQ01097 1482 aa37.6■■■■□ 3.61
Usf1-210ENSMUST00000167546 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP37.59■■■■□ 3.61
Usf1-210ENSMUST00000167546 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP37.58■■■■□ 3.61
Usf1-210ENSMUST00000167546 Duox2A2AQ99 1517 aa37.55■■■■□ 3.6
Usf1-210ENSMUST00000167546 Ift140E9PY46 1464 aa37.37■■■■□ 3.57
Usf1-210ENSMUST00000167546 Efcab5A0JP43 1406 aa37.36■■■■□ 3.57
Usf1-210ENSMUST00000167546 HrcG5E8J6 738 aa37.33■■■■□ 3.57
Usf1-210ENSMUST00000167546 NrkQ9R0G8 1455 aa37.32■■■■□ 3.56
Usf1-210ENSMUST00000167546 Samd9lQ69Z37 1561 aa37.24■■■■□ 3.55
Usf1-210ENSMUST00000167546 Disp1Q3TDN0 1521 aa37.16■■■■□ 3.54
Usf1-210ENSMUST00000167546 Shroom4Q1W617 1475 aa37.16■■■■□ 3.54
Usf1-210ENSMUST00000167546 Rusc2Q80U22 1514 aa37.12■■■■□ 3.53
Usf1-210ENSMUST00000167546 PtprkP35822 1457 aa37.12■■■■□ 3.53
Usf1-210ENSMUST00000167546 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
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Usf1-210ENSMUST00000167546 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
Usf1-210ENSMUST00000167546 Setd1bQ8CFT2 1985 aa36.93■■■■□ 3.5
Usf1-210ENSMUST00000167546 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa36.91■■■■□ 3.5
Usf1-210ENSMUST00000167546 Magi3Q9EQJ9 1476 aa36.87■■■■□ 3.49
Usf1-210ENSMUST00000167546 Grin2aP35436 1464 aa36.87■■■■□ 3.49
Usf1-210ENSMUST00000167546 Shroom2A2ALU4 1481 aa36.84■■■■□ 3.49
Usf1-210ENSMUST00000167546 Npm2Q80W85 207 aa36.84■■■■□ 3.49
Usf1-210ENSMUST00000167546 SynmQ70IV5 1561 aa36.83■■■■□ 3.49
Usf1-210ENSMUST00000167546 Zeb1Q64318 1117 aa36.8■■■■□ 3.48
Usf1-210ENSMUST00000167546 Gab3Q8BSM5 595 aa36.8■■■■□ 3.48
Usf1-210ENSMUST00000167546 Pla2r1Q62028 1487 aa36.71■■■■□ 3.47
Usf1-210ENSMUST00000167546 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa36.69■■■■□ 3.46
Usf1-210ENSMUST00000167546 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
Usf1-210ENSMUST00000167546 Gpatch8A2A6A1 1505 aa36.65■■■■□ 3.46
Usf1-210ENSMUST00000167546 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa36.64■■■■□ 3.46
Usf1-210ENSMUST00000167546 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
Usf1-210ENSMUST00000167546 Arhgap35Q91YM2 1499 aa36.49■■■■□ 3.43
Usf1-210ENSMUST00000167546 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
Usf1-210ENSMUST00000167546 Map3k1P53349 1493 aa36.45■■■■□ 3.43
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