RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000162246.8

Hmgn3-202, Transcript of High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hmgn3, Length 983 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa54.7■■■■■ 6.35
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 NischQ80TM9 1593 aa53.81■■■■■ 6.2
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Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Abcc9P70170 1546 aa51.94■■■■■ 5.9
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 ScribQ80U72 1612 aa50.73■■■■■ 5.71
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 NacadQ5SWP3 1504 aa49.12■■■■■ 5.45
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Kdm5dQ62240 1548 aa48.93■■■■■ 5.42
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Sycp2Q9CUU3 1500 aa48.17■■■■■ 5.3
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Dcaf1Q80TR8 1506 aa47.81■■■■■ 5.24
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 BicraF8VPZ9 1578 aa47.59■■■■■ 5.21
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa47.49■■■■■ 5.19
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa46.83■■■■■ 5.09
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Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP46.3■■■■■ 5
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Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Crybg2B7ZCC2 1516 aa46.03■■■■■ 4.96
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Rhox8Q6VSS7 320 aa45.98■■■■■ 4.95
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP45.9■■■■■ 4.94
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Ccdc180J3QNE4 1664 aa45.86■■■■■ 4.93
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP45.67■■■■■ 4.9
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa45.58■■■■■ 4.89
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Ercc6F8VPZ5 1481 aa45.53■■■■■ 4.88
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Smarca2Q6DIC0 1577 aa45.28■■■■■ 4.84
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP45.2■■■■■ 4.83
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Fam135aQ6NS59 1506 aa45.12■■■■■ 4.81
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa45.07■■■■■ 4.81
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa44.88■■■■■ 4.78
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Wdr62Q3U3T8 1523 aa44.78■■■■■ 4.76
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Frmpd1A2AKB4 1549 aa44.75■■■■■ 4.75
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP44.74■■■■■ 4.75
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Baz1bQ9Z277 1479 aa44.59■■■■■ 4.73
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Ubl4bQ9CQ84 188 aa44.44■■■■■ 4.7
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Mrc2Q64449 1479 aa44.13■■■■■ 4.65
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Unc13aQ4KUS2 1712 aa43.99■■■■■ 4.63
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 CftrP26361 1476 aa43.73■■■■■ 4.59
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Dnajc5P60904 198 aa43.73■■■■■ 4.59
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa43.66■■■■■ 4.58
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Trim41Q5NCC3 630 aa43.62■■■■■ 4.57
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Synj1Q8CHC4 1574 aa43.54■■■■■ 4.56
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP43.46■■■■■ 4.55
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Rtl1Q7M732 1744 aa43.26■■■■■ 4.52
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa43.17■■■■■ 4.5
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa43.16■■■■■ 4.5
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Cux2P70298 1426 aa43.13■■■■■ 4.49
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP43.1■■■■■ 4.49
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP43.03■■■■■ 4.48
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Kif15Q6P9L6 1387 aa43.01■■■■■ 4.48
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Kif21aQ9QXL2 1672 aa42.86■■■■■ 4.45
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP42.71■■■■■ 4.43
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Lamc3Q9R0B6 1581 aa42.58■■■■■ 4.41
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP42.55■■■■■ 4.4
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Shroom2A2ALU4 1481 aa42.48■■■■■ 4.39
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Cep164Q5DU05 1446 aa42.44■■■■■ 4.38
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP42.16■■■■■ 4.34
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Plb1Q3TTY0 1478 aa42.14■■■■■ 4.34
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Il27Q8K3I6 234 aa42.12■■■■■ 4.33
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Ccdc18Q640L5 1455 aa42.07■■■■■ 4.33
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Col17a1Q07563 1470 aa42.04■■■■■ 4.32
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP41.96■■■■■ 4.31
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Crocc2F6XLV1 1638 aa41.88■■■■■ 4.3
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Top2bQ64511 1612 aa41.88■■■■■ 4.3
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 TnnQ80Z71 1560 aa41.84■■■■■ 4.29
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Camsap1A2AHC3 1581 aa41.75■■■■■ 4.27
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Ift140E9PY46 1464 aa41.72■■■■■ 4.27
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Rusc2Q80U22 1514 aa41.68■■■■■ 4.26
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Golga3P55937 1487 aa41.64■■■■■ 4.26
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Cngb1E1AZ71 1325 aa41.63■■■■■ 4.25
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Duox2A2AQ99 1517 aa41.41■■■■■ 4.22
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Fmn1Q05860 1466 aa41.31■■■■■ 4.2
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Disp1Q3TDN0 1521 aa41.29■■■■■ 4.2
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Grin2bQ01097 1482 aa41.15■■■■■ 4.18
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa41.14■■■■■ 4.18
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP41.11■■■■■ 4.17
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP41.04■■■■■ 4.16
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Samd9lQ69Z37 1561 aa41.02■■■■■ 4.16
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Setd1bQ8CFT2 1985 aa40.95■■■■■ 4.15
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Efcab5A0JP43 1406 aa40.94■■■■■ 4.14
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Adgrl3Q80TS3 1537 aa40.94■■■■■ 4.14
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa40.88■■■■■ 4.13
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 PtprkP35822 1457 aa40.87■■■■■ 4.13
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa40.86■■■■■ 4.13
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Fgd6Q69ZL1 1399 aa40.86■■■■■ 4.13
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Rad54l2Q99NG0 1466 aa40.83■■■■■ 4.13
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa40.83■■■■■ 4.13
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Grin2aP35436 1464 aa40.77■■■■■ 4.12
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Cep170Q6A065 1588 aa40.75■■■■■ 4.11
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Gm156Q58A37 223 aa40.75■■■■■ 4.11
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa40.75■■■■■ 4.11
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Magi3Q9EQJ9 1476 aa40.69■■■■■ 4.1
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 PtprtQ99M80 1454 aa40.59■■■■■ 4.09
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 AknaQ80VW7 1404 aa40.58■■■■■ 4.09
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 NrkQ9R0G8 1455 aa40.5■■■■■ 4.07
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Abcc1O35379 1528 aa40.47■■■■■ 4.07
Hmgn3-202ENSMUST00000162246 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
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