RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000106659.2

Amigo1-203, Transcript of Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Amigo1, Length 1,360 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa55.04■■■■■ 6.4
Amigo1-203ENSMUST00000106659 NischQ80TM9 1593 aa54.46■■■■■ 6.31
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Abcc9P70170 1546 aa52.77■■■■■ 6.04
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Abcc8B2RUS7 1588 aa52.55■■■■■ 6
Amigo1-203ENSMUST00000106659 ScribQ80U72 1612 aa50.38■■■■■ 5.66
Amigo1-203ENSMUST00000106659 NacadQ5SWP3 1504 aa48.86■■■■■ 5.41
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Kdm5dQ62240 1548 aa48.81■■■■■ 5.4
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Dcaf1Q80TR8 1506 aa48.55■■■■■ 5.36
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Sycp2Q9CUU3 1500 aa47.89■■■■■ 5.26
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa47.49■■■■■ 5.19
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Rhox8Q6VSS7 320 aa47.39■■■■■ 5.18
Amigo1-203ENSMUST00000106659 BicraF8VPZ9 1578 aa47.15■■■■■ 5.14
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Ccdc180J3QNE4 1664 aa46.99■■■■■ 5.11
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Baz1aO88379 1555 aa46.89■■■■■ 5.1
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa46.8■■■■■ 5.08
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Crybg2B7ZCC2 1516 aa46.7■■■■■ 5.07
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP46.04■■■■■ 4.96
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP45.71■■■■■ 4.91
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Smarca2Q6DIC0 1577 aa45.57■■■■■ 4.89
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP45.52■■■■■ 4.88
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP45.39■■■■■ 4.86
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Rtl1Q7M732 1744 aa45.23■■■■■ 4.83
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa45.21■■■■■ 4.83
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP45.2■■■■■ 4.83
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa44.87■■■■■ 4.77
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa44.78■■■■■ 4.76
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Ercc6F8VPZ5 1481 aa44.72■■■■■ 4.75
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Wdr62Q3U3T8 1523 aa44.43■■■■■ 4.7
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Frmpd1A2AKB4 1549 aa44.37■■■■■ 4.69
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Fam135aQ6NS59 1506 aa44.32■■■■■ 4.69
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa44.31■■■■■ 4.68
Amigo1-203ENSMUST00000106659 CftrP26361 1476 aa44.29■■■■■ 4.68
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP44.29■■■■■ 4.68
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Synj1Q8CHC4 1574 aa44.23■■■■■ 4.67
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa44.22■■■■■ 4.67
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP44.01■■■■■ 4.64
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Unc13aQ4KUS2 1712 aa43.8■■■■■ 4.6
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Baz1bQ9Z277 1479 aa43.78■■■■■ 4.6
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Trim41Q5NCC3 630 aa43.72■■■■■ 4.59
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Ubl4bQ9CQ84 188 aa43.56■■■■■ 4.56
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP43.42■■■■■ 4.54
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Mrc2Q64449 1479 aa43.28■■■■■ 4.52
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP43.03■■■■■ 4.48
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Dnajc5P60904 198 aa42.94■■■■■ 4.46
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Golga3P55937 1487 aa42.91■■■■■ 4.46
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Lamc3Q9R0B6 1581 aa42.9■■■■■ 4.46
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Kif15Q6P9L6 1387 aa42.9■■■■■ 4.46
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Top2bQ64511 1612 aa42.84■■■■■ 4.45
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Cux2P70298 1426 aa42.79■■■■■ 4.44
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Cngb1E1AZ71 1325 aa42.61■■■■■ 4.41
Amigo1-203ENSMUST00000106659 TnnQ80Z71 1560 aa42.58■■■■■ 4.41
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa42.42■■■■■ 4.38
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Kif21aQ9QXL2 1672 aa42.34■■■■■ 4.37
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Fmn1Q05860 1466 aa42.34■■■■■ 4.37
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP42.33■■■■■ 4.37
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Cep164Q5DU05 1446 aa42.25■■■■■ 4.35
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Ccdc18Q640L5 1455 aa42.21■■■■■ 4.35
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Camsap1A2AHC3 1581 aa42.16■■■■■ 4.34
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Il27Q8K3I6 234 aa42.01■■■■■ 4.31
Amigo1-203ENSMUST00000106659 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP41.92■■■■■ 4.3
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa41.86■■■■■ 4.29
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
Amigo1-203ENSMUST00000106659 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP41.75■■■■■ 4.27
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Crocc2F6XLV1 1638 aa41.73■■■■■ 4.27
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Plb1Q3TTY0 1478 aa41.69■■■■■ 4.26
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Shroom2A2ALU4 1481 aa41.68■■■■■ 4.26
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Grin2bQ01097 1482 aa41.63■■■■■ 4.26
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Chic1Q8CBW7 227 aa41.61■■■■■ 4.25
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Duox2A2AQ99 1517 aa41.55■■■■■ 4.24
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Ift140E9PY46 1464 aa41.37■■■■■ 4.21
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Efcab5A0JP43 1406 aa41.37■■■■■ 4.21
Amigo1-203ENSMUST00000106659 NrkQ9R0G8 1455 aa41.33■■■■■ 4.21
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Col17a1Q07563 1470 aa41.31■■■■■ 4.2
Amigo1-203ENSMUST00000106659 HrcG5E8J6 738 aa41.3■■■■■ 4.2
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Samd9lQ69Z37 1561 aa41.23■■■■■ 4.19
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Disp1Q3TDN0 1521 aa41.17■■■■■ 4.18
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Shroom4Q1W617 1475 aa41.14■■■■■ 4.18
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Rusc2Q80U22 1514 aa41.1■■■■■ 4.17
Amigo1-203ENSMUST00000106659 PtprkP35822 1457 aa41.1■■■■■ 4.17
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Setd1bQ8CFT2 1985 aa40.96■■■■■ 4.15
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Rad54l2Q99NG0 1466 aa40.93■■■■■ 4.14
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa40.87■■■■■ 4.13
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Magi3Q9EQJ9 1476 aa40.85■■■■■ 4.13
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Grin2aP35436 1464 aa40.81■■■■■ 4.12
Amigo1-203ENSMUST00000106659 SynmQ70IV5 1561 aa40.78■■■■■ 4.12
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Gpatch8A2A6A1 1505 aa40.69■■■■■ 4.1
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Pla2r1Q62028 1487 aa40.65■■■■■ 4.1
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Npm2Q80W85 207 aa40.61■■■■■ 4.09
Amigo1-203ENSMUST00000106659 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa40.61■■■■■ 4.09
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Gab3Q8BSM5 595 aa40.57■■■■■ 4.08
Amigo1-203ENSMUST00000106659 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa40.56■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 171.9 ms