RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089584.6

Spr-ps1-201, mousemouse

BASIC

Gene Spr-ps1, Length 605 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa38.04■■■■□ 3.68
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 NischQ80TM9 1593 aa37.33■■■■□ 3.57
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Abcc8B2RUS7 1588 aa36.24■■■■□ 3.39
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Abcc9P70170 1546 aa36.13■■■■□ 3.38
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 ScribQ80U72 1612 aa35.34■■■■□ 3.25
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 NacadQ5SWP3 1504 aa34.09■■■■□ 3.05
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Kdm5dQ62240 1548 aa34.04■■■■□ 3.04
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Sycp2Q9CUU3 1500 aa33.46■■■□□ 2.95
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Dcaf1Q80TR8 1506 aa33.2■■■□□ 2.91
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 BicraF8VPZ9 1578 aa33.13■■■□□ 2.89
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa33.09■■■□□ 2.89
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa32.51■■■□□ 2.79
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.76
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.75
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Baz1aO88379 1555 aa31.98■■■□□ 2.71
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Crybg2B7ZCC2 1516 aa31.85■■■□□ 2.69
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Ccdc180J3QNE4 1664 aa31.8■■■□□ 2.68
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Rhox8Q6VSS7 320 aa31.74■■■□□ 2.67
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa31.72■■■□□ 2.67
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Ercc6F8VPZ5 1481 aa31.61■■■□□ 2.65
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Smarca2Q6DIC0 1577 aa31.45■■■□□ 2.63
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Fam135aQ6NS59 1506 aa31.4■■■□□ 2.62
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa31.32■■■□□ 2.6
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa31.17■■■□□ 2.58
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Wdr62Q3U3T8 1523 aa31.14■■■□□ 2.57
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Frmpd1A2AKB4 1549 aa31.09■■■□□ 2.57
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Baz1bQ9Z277 1479 aa30.92■■■□□ 2.54
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Ubl4bQ9CQ84 188 aa30.78■■■□□ 2.52
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Mrc2Q64449 1479 aa30.67■■■□□ 2.5
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Unc13aQ4KUS2 1712 aa30.65■■■□□ 2.5
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Dnajc5P60904 198 aa30.45■■■□□ 2.47
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Trim41Q5NCC3 630 aa30.36■■■□□ 2.45
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 CftrP26361 1476 aa30.32■■■□□ 2.44
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa30.3■■■□□ 2.44
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Synj1Q8CHC4 1574 aa30.23■■■□□ 2.43
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa30.06■■■□□ 2.4
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Rtl1Q7M732 1744 aa29.97■■■□□ 2.39
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Cux2P70298 1426 aa29.91■■■□□ 2.38
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Kif21aQ9QXL2 1672 aa29.84■■■□□ 2.37
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Kif15Q6P9L6 1387 aa29.81■■■□□ 2.36
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa29.81■■■□□ 2.36
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Lamc3Q9R0B6 1581 aa29.56■■■□□ 2.32
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Shroom2A2ALU4 1481 aa29.55■■■□□ 2.32
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Cep164Q5DU05 1446 aa29.39■■■□□ 2.3
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Col17a1Q07563 1470 aa29.27■■■□□ 2.28
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Plb1Q3TTY0 1478 aa29.26■■■□□ 2.27
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Il27Q8K3I6 234 aa29.16■■■□□ 2.26
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Top2bQ64511 1612 aa29.13■■■□□ 2.25
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Ccdc18Q640L5 1455 aa29.13■■■□□ 2.25
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Crocc2F6XLV1 1638 aa29.1■■■□□ 2.25
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 TnnQ80Z71 1560 aa29.06■■■□□ 2.24
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Camsap1A2AHC3 1581 aa29■■■□□ 2.23
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Rusc2Q80U22 1514 aa28.99■■■□□ 2.23
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Ift140E9PY46 1464 aa28.94■■■□□ 2.22
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Golga3P55937 1487 aa28.81■■■□□ 2.2
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Cngb1E1AZ71 1325 aa28.76■■■□□ 2.19
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Duox2A2AQ99 1517 aa28.71■■■□□ 2.19
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Disp1Q3TDN0 1521 aa28.66■■■□□ 2.18
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Fmn1Q05860 1466 aa28.6■■■□□ 2.17
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Grin2bQ01097 1482 aa28.53■■■□□ 2.16
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Samd9lQ69Z37 1561 aa28.53■■■□□ 2.16
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa28.52■■■□□ 2.16
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Setd1bQ8CFT2 1985 aa28.51■■■□□ 2.15
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Adgrl3Q80TS3 1537 aa28.47■■■□□ 2.15
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa28.46■■■□□ 2.15
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa28.42■■■□□ 2.14
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 PtprkP35822 1457 aa28.37■■■□□ 2.13
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa28.37■■■□□ 2.13
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Cep170Q6A065 1588 aa28.36■■■□□ 2.13
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Rad54l2Q99NG0 1466 aa28.34■■■□□ 2.13
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Efcab5A0JP43 1406 aa28.33■■■□□ 2.13
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Fgd6Q69ZL1 1399 aa28.32■■■□□ 2.12
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa28.32■■■□□ 2.12
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Grin2aP35436 1464 aa28.29■■■□□ 2.12
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Magi3Q9EQJ9 1476 aa28.27■■■□□ 2.12
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Gm156Q58A37 223 aa28.26■■■□□ 2.11
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 PtprtQ99M80 1454 aa28.23■■■□□ 2.11
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 AknaQ80VW7 1404 aa28.17■■■□□ 2.1
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Abcc1O35379 1528 aa28.12■■■□□ 2.09
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 Pla2r1Q62028 1487 aa28.04■■■□□ 2.08
Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 NrkQ9R0G8 1455 aa28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 104.9 ms