RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000071543.11

Upp2-202, Transcript of Uridine phosphorylase 2, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Upp2, Length 2,150 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2-202ENSMUST00000071543 NischQ80TM9 1593 aa47.77■■■■■ 5.24
Upp2-202ENSMUST00000071543 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa46.88■■■■■ 5.1
Upp2-202ENSMUST00000071543 Abcc9P70170 1546 aa46.49■■■■■ 5.03
Upp2-202ENSMUST00000071543 Abcc8B2RUS7 1588 aa45.29■■■■■ 4.84
Upp2-202ENSMUST00000071543 Rtl1Q7M732 1744 aa44.68■■■■■ 4.74
Upp2-202ENSMUST00000071543 Rhox8Q6VSS7 320 aa44.5■■■■■ 4.71
Upp2-202ENSMUST00000071543 Ccdc180J3QNE4 1664 aa43.9■■■■■ 4.62
Upp2-202ENSMUST00000071543 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP42.87■■■■■ 4.45
Upp2-202ENSMUST00000071543 Dcaf1Q80TR8 1506 aa42.46■■■■■ 4.39
Upp2-202ENSMUST00000071543 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa42.32■■■■■ 4.36
Upp2-202ENSMUST00000071543 ScribQ80U72 1612 aa41.94■■■■■ 4.3
Upp2-202ENSMUST00000071543 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa41.89■■■■■ 4.3
Upp2-202ENSMUST00000071543 HrcG5E8J6 738 aa41.73■■■■■ 4.27
Upp2-202ENSMUST00000071543 Baz1aO88379 1555 aa41.47■■■■■ 4.23
Upp2-202ENSMUST00000071543 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
Upp2-202ENSMUST00000071543 Kdm5dQ62240 1548 aa41.27■■■■■ 4.2
Upp2-202ENSMUST00000071543 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa41.19■■■■■ 4.18
Upp2-202ENSMUST00000071543 NacadQ5SWP3 1504 aa40.91■■■■■ 4.14
Upp2-202ENSMUST00000071543 Crybg2B7ZCC2 1516 aa40.7■■■■■ 4.11
Upp2-202ENSMUST00000071543 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.1
Upp2-202ENSMUST00000071543 Trim41Q5NCC3 630 aa40.6■■■■■ 4.09
Upp2-202ENSMUST00000071543 Smarca2Q6DIC0 1577 aa40.59■■■■■ 4.09
Upp2-202ENSMUST00000071543 Cep164Q5DU05 1446 aa40.34■■■■■ 4.05
Upp2-202ENSMUST00000071543 Sycp2Q9CUU3 1500 aa40■■■■□ 3.99
Upp2-202ENSMUST00000071543 Pcgf6Q99NA9 353 aa39.85■■■■□ 3.97
Upp2-202ENSMUST00000071543 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP39.61■■■■□ 3.93
Upp2-202ENSMUST00000071543 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP39.58■■■■□ 3.93
Upp2-202ENSMUST00000071543 Chic1Q8CBW7 227 aa39.43■■■■□ 3.9
Upp2-202ENSMUST00000071543 Cngb1E1AZ71 1325 aa39.39■■■■□ 3.9
Upp2-202ENSMUST00000071543 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa39.37■■■■□ 3.89
Upp2-202ENSMUST00000071543 Golga3P55937 1487 aa39.36■■■■□ 3.89
Upp2-202ENSMUST00000071543 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa39.24■■■■□ 3.87
Upp2-202ENSMUST00000071543 Synj1Q8CHC4 1574 aa39.21■■■■□ 3.87
Upp2-202ENSMUST00000071543 Gab3Q8BSM5 595 aa39.11■■■■□ 3.85
Upp2-202ENSMUST00000071543 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP39.07■■■■□ 3.85
Upp2-202ENSMUST00000071543 BicraF8VPZ9 1578 aa39.02■■■■□ 3.84
Upp2-202ENSMUST00000071543 CftrP26361 1476 aa38.92■■■■□ 3.82
Upp2-202ENSMUST00000071543 Top2bQ64511 1612 aa38.89■■■■□ 3.82
Upp2-202ENSMUST00000071543 NefmP08553 848 aa38.82■■■■□ 3.81
Upp2-202ENSMUST00000071543 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa38.72■■■■□ 3.79
Upp2-202ENSMUST00000071543 Mier1Q5UAK0 511 aa38.67■■■■□ 3.78
Upp2-202ENSMUST00000071543 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP38.6■■■■□ 3.77
Upp2-202ENSMUST00000071543 Zeb1Q64318 1117 aa38.42■■■■□ 3.74
Upp2-202ENSMUST00000071543 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa38.41■■■■□ 3.74
Upp2-202ENSMUST00000071543 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP38.38■■■■□ 3.73
Upp2-202ENSMUST00000071543 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa38.35■■■■□ 3.73
Upp2-202ENSMUST00000071543 Fmn1Q05860 1466 aa38.25■■■■□ 3.71
Upp2-202ENSMUST00000071543 Neurod1Q60867 357 aa38.19■■■■□ 3.7
Upp2-202ENSMUST00000071543 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP38.17■■■■□ 3.7
Upp2-202ENSMUST00000071543 Sall2Q9QX96 1004 aa38.05■■■■□ 3.68
Upp2-202ENSMUST00000071543 Cep162Q6ZQ06 1403 aa37.97■■■■□ 3.67
Upp2-202ENSMUST00000071543 UbtfP25976 765 aaKnown RBP37.89■■■■□ 3.66
Upp2-202ENSMUST00000071543 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa37.77■■■■□ 3.64
Upp2-202ENSMUST00000071543 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP37.69■■■■□ 3.62
Upp2-202ENSMUST00000071543 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP37.68■■■■□ 3.62
Upp2-202ENSMUST00000071543 Myt1lP97500 1187 aa37.58■■■■□ 3.61
Upp2-202ENSMUST00000071543 TnnQ80Z71 1560 aa37.5■■■■□ 3.59
Upp2-202ENSMUST00000071543 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP37.48■■■■□ 3.59
Upp2-202ENSMUST00000071543 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP37.48■■■■□ 3.59
Upp2-202ENSMUST00000071543 Anks4bQ8K3X6 423 aa37.48■■■■□ 3.59
Upp2-202ENSMUST00000071543 Npm2Q80W85 207 aa37.45■■■■□ 3.59
Upp2-202ENSMUST00000071543 Clip1Q922J3 1391 aa37.44■■■■□ 3.58
Upp2-202ENSMUST00000071543 Wdr66E9Q743 1299 aa37.42■■■■□ 3.58
Upp2-202ENSMUST00000071543 ClspnQ80YR7 1315 aa37.42■■■■□ 3.58
Upp2-202ENSMUST00000071543 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa37.32■■■■□ 3.57
Upp2-202ENSMUST00000071543 TonslQ6NZL6 1363 aa37.26■■■■□ 3.55
Upp2-202ENSMUST00000071543 Arhgap35Q91YM2 1499 aa37.21■■■■□ 3.55
Upp2-202ENSMUST00000071543 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
Upp2-202ENSMUST00000071543 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa37.17■■■■□ 3.54
Upp2-202ENSMUST00000071543 NrkQ9R0G8 1455 aa37.16■■■■□ 3.54
Upp2-202ENSMUST00000071543 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
Upp2-202ENSMUST00000071543 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP37.05■■■■□ 3.52
Upp2-202ENSMUST00000071543 Lamc3Q9R0B6 1581 aa37.03■■■■□ 3.52
Upp2-202ENSMUST00000071543 PtprkP35822 1457 aa37.03■■■■□ 3.52
Upp2-202ENSMUST00000071543 Eea1Q8BL66 1411 aa37.01■■■■□ 3.52
Upp2-202ENSMUST00000071543 Arap1Q4LDD4 1452 aa36.99■■■■□ 3.51
Upp2-202ENSMUST00000071543 Frmpd1A2AKB4 1549 aa36.96■■■■□ 3.51
Upp2-202ENSMUST00000071543 Wdr62Q3U3T8 1523 aa36.95■■■■□ 3.51
Upp2-202ENSMUST00000071543 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa36.92■■■■□ 3.5
Upp2-202ENSMUST00000071543 Ccdc18Q640L5 1455 aa36.9■■■■□ 3.5
Upp2-202ENSMUST00000071543 Map3k1P53349 1493 aa36.9■■■■□ 3.5
Upp2-202ENSMUST00000071543 Shroom4Q1W617 1475 aa36.88■■■■□ 3.5
Upp2-202ENSMUST00000071543 Csrnp3P59055 597 aa36.88■■■■□ 3.5
Upp2-202ENSMUST00000071543 Kdm5bQ80Y84 1544 aa36.85■■■■□ 3.49
Upp2-202ENSMUST00000071543 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa36.84■■■■□ 3.49
Upp2-202ENSMUST00000071543 Camsap1A2AHC3 1581 aa36.78■■■■□ 3.48
Upp2-202ENSMUST00000071543 Setd5Q5XJV7 1441 aa36.75■■■■□ 3.47
Upp2-202ENSMUST00000071543 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa36.74■■■■□ 3.47
Upp2-202ENSMUST00000071543 Kif15Q6P9L6 1387 aa36.7■■■■□ 3.47
Upp2-202ENSMUST00000071543 Tiam1Q60610 1591 aa36.67■■■■□ 3.46
Upp2-202ENSMUST00000071543 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa36.66■■■■□ 3.46
Upp2-202ENSMUST00000071543 Erich3F6QRE9 1637 aa36.6■■■■□ 3.45
Upp2-202ENSMUST00000071543 Unc13aQ4KUS2 1712 aa36.6■■■■□ 3.45
Upp2-202ENSMUST00000071543 Aplp2Q06335 707 aa36.58■■■■□ 3.45
Upp2-202ENSMUST00000071543 Grin2bQ01097 1482 aa36.55■■■■□ 3.44
Upp2-202ENSMUST00000071543 Il27Q8K3I6 234 aa36.55■■■■□ 3.44
Upp2-202ENSMUST00000071543 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa36.55■■■■□ 3.44
Upp2-202ENSMUST00000071543 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa36.55■■■■□ 3.44
Upp2-202ENSMUST00000071543 Ercc6F8VPZ5 1481 aa36.52■■■■□ 3.44
Upp2-202ENSMUST00000071543 Naip1Q9QWK5 1403 aa36.48■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.3 ms