RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029047.11

Snx16-201, Transcript of Sorting nexin-16, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Snx16, Length 2,288 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16-201ENSMUST00000029047 NischQ80TM9 1593 aa31.63■■■□□ 2.65
Snx16-201ENSMUST00000029047 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa31.04■■■□□ 2.56
Snx16-201ENSMUST00000029047 Abcc9P70170 1546 aa30.76■■■□□ 2.51
Snx16-201ENSMUST00000029047 Abcc8B2RUS7 1588 aa29.95■■■□□ 2.39
Snx16-201ENSMUST00000029047 Rtl1Q7M732 1744 aa29.57■■■□□ 2.32
Snx16-201ENSMUST00000029047 Rhox8Q6VSS7 320 aa29.48■■■□□ 2.31
Snx16-201ENSMUST00000029047 Ccdc180J3QNE4 1664 aa29.02■■■□□ 2.24
Snx16-201ENSMUST00000029047 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
Snx16-201ENSMUST00000029047 Dcaf1Q80TR8 1506 aa28.02■■■□□ 2.08
Snx16-201ENSMUST00000029047 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa27.84■■■□□ 2.05
Snx16-201ENSMUST00000029047 ScribQ80U72 1612 aa27.81■■■□□ 2.04
Snx16-201ENSMUST00000029047 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa27.77■■■□□ 2.04
Snx16-201ENSMUST00000029047 HrcG5E8J6 738 aa27.47■■□□□ 1.99
Snx16-201ENSMUST00000029047 Baz1aO88379 1555 aa27.44■■□□□ 1.98
Snx16-201ENSMUST00000029047 Kdm5dQ62240 1548 aa27.35■■□□□ 1.97
Snx16-201ENSMUST00000029047 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
Snx16-201ENSMUST00000029047 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa27.29■■□□□ 1.96
Snx16-201ENSMUST00000029047 NacadQ5SWP3 1504 aa27.07■■□□□ 1.92
Snx16-201ENSMUST00000029047 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
Snx16-201ENSMUST00000029047 Smarca2Q6DIC0 1577 aa26.86■■□□□ 1.89
Snx16-201ENSMUST00000029047 Trim41Q5NCC3 630 aa26.84■■□□□ 1.89
Snx16-201ENSMUST00000029047 Crybg2B7ZCC2 1516 aa26.84■■□□□ 1.89
Snx16-201ENSMUST00000029047 Cep164Q5DU05 1446 aa26.64■■□□□ 1.86
Snx16-201ENSMUST00000029047 Sycp2Q9CUU3 1500 aa26.46■■□□□ 1.83
Snx16-201ENSMUST00000029047 Pcgf6Q99NA9 353 aa26.26■■□□□ 1.79
Snx16-201ENSMUST00000029047 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
Snx16-201ENSMUST00000029047 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
Snx16-201ENSMUST00000029047 Cngb1E1AZ71 1325 aa26.11■■□□□ 1.77
Snx16-201ENSMUST00000029047 Chic1Q8CBW7 227 aa26.06■■□□□ 1.76
Snx16-201ENSMUST00000029047 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa26.05■■□□□ 1.76
Snx16-201ENSMUST00000029047 Golga3P55937 1487 aa26.01■■□□□ 1.76
Snx16-201ENSMUST00000029047 Synj1Q8CHC4 1574 aa25.97■■□□□ 1.75
Snx16-201ENSMUST00000029047 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa25.95■■□□□ 1.75
Snx16-201ENSMUST00000029047 Gab3Q8BSM5 595 aa25.91■■□□□ 1.74
Snx16-201ENSMUST00000029047 BicraF8VPZ9 1578 aa25.85■■□□□ 1.73
Snx16-201ENSMUST00000029047 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
Snx16-201ENSMUST00000029047 Top2bQ64511 1612 aa25.74■■□□□ 1.71
Snx16-201ENSMUST00000029047 CftrP26361 1476 aa25.73■■□□□ 1.71
Snx16-201ENSMUST00000029047 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa25.66■■□□□ 1.7
Snx16-201ENSMUST00000029047 NefmP08553 848 aa25.58■■□□□ 1.69
Snx16-201ENSMUST00000029047 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
Snx16-201ENSMUST00000029047 Mier1Q5UAK0 511 aa25.53■■□□□ 1.68
Snx16-201ENSMUST00000029047 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa25.5■■□□□ 1.67
Snx16-201ENSMUST00000029047 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
Snx16-201ENSMUST00000029047 Zeb1Q64318 1117 aa25.42■■□□□ 1.66
Snx16-201ENSMUST00000029047 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa25.33■■□□□ 1.65
Snx16-201ENSMUST00000029047 Fmn1Q05860 1466 aa25.29■■□□□ 1.64
Snx16-201ENSMUST00000029047 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
Snx16-201ENSMUST00000029047 Neurod1Q60867 357 aa25.17■■□□□ 1.62
Snx16-201ENSMUST00000029047 Sall2Q9QX96 1004 aa25.11■■□□□ 1.61
Snx16-201ENSMUST00000029047 Cep162Q6ZQ06 1403 aa25.09■■□□□ 1.61
Snx16-201ENSMUST00000029047 UbtfP25976 765 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
Snx16-201ENSMUST00000029047 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa25.04■■□□□ 1.6
Snx16-201ENSMUST00000029047 Myt1lP97500 1187 aa24.92■■□□□ 1.58
Snx16-201ENSMUST00000029047 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
Snx16-201ENSMUST00000029047 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
Snx16-201ENSMUST00000029047 Npm2Q80W85 207 aa24.82■■□□□ 1.56
Snx16-201ENSMUST00000029047 TnnQ80Z71 1560 aa24.82■■□□□ 1.56
Snx16-201ENSMUST00000029047 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
Snx16-201ENSMUST00000029047 Wdr66E9Q743 1299 aa24.77■■□□□ 1.56
Snx16-201ENSMUST00000029047 Clip1Q922J3 1391 aa24.75■■□□□ 1.55
Snx16-201ENSMUST00000029047 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
Snx16-201ENSMUST00000029047 ClspnQ80YR7 1315 aa24.68■■□□□ 1.54
Snx16-201ENSMUST00000029047 Anks4bQ8K3X6 423 aa24.65■■□□□ 1.54
Snx16-201ENSMUST00000029047 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa24.64■■□□□ 1.54
Snx16-201ENSMUST00000029047 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa24.62■■□□□ 1.53
Snx16-201ENSMUST00000029047 TonslQ6NZL6 1363 aa24.61■■□□□ 1.53
Snx16-201ENSMUST00000029047 Arhgap35Q91YM2 1499 aa24.6■■□□□ 1.53
Snx16-201ENSMUST00000029047 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
Snx16-201ENSMUST00000029047 NrkQ9R0G8 1455 aa24.55■■□□□ 1.52
Snx16-201ENSMUST00000029047 Lamc3Q9R0B6 1581 aa24.5■■□□□ 1.51
Snx16-201ENSMUST00000029047 PtprkP35822 1457 aa24.49■■□□□ 1.51
Snx16-201ENSMUST00000029047 Wdr62Q3U3T8 1523 aa24.48■■□□□ 1.51
Snx16-201ENSMUST00000029047 Frmpd1A2AKB4 1549 aa24.47■■□□□ 1.51
Snx16-201ENSMUST00000029047 Arap1Q4LDD4 1452 aa24.46■■□□□ 1.51
Snx16-201ENSMUST00000029047 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
Snx16-201ENSMUST00000029047 Eea1Q8BL66 1411 aa24.46■■□□□ 1.51
Snx16-201ENSMUST00000029047 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
Snx16-201ENSMUST00000029047 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa24.4■■□□□ 1.5
Snx16-201ENSMUST00000029047 Shroom4Q1W617 1475 aa24.39■■□□□ 1.5
Snx16-201ENSMUST00000029047 Map3k1P53349 1493 aa24.37■■□□□ 1.49
Snx16-201ENSMUST00000029047 Ccdc18Q640L5 1455 aa24.36■■□□□ 1.49
Snx16-201ENSMUST00000029047 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa24.36■■□□□ 1.49
Snx16-201ENSMUST00000029047 Camsap1A2AHC3 1581 aa24.35■■□□□ 1.49
Snx16-201ENSMUST00000029047 Unc13aQ4KUS2 1712 aa24.33■■□□□ 1.49
Snx16-201ENSMUST00000029047 Csrnp3P59055 597 aa24.33■■□□□ 1.49
Snx16-201ENSMUST00000029047 Kdm5bQ80Y84 1544 aa24.31■■□□□ 1.48
Snx16-201ENSMUST00000029047 Kif15Q6P9L6 1387 aa24.31■■□□□ 1.48
Snx16-201ENSMUST00000029047 Setd5Q5XJV7 1441 aa24.31■■□□□ 1.48
Snx16-201ENSMUST00000029047 Tiam1Q60610 1591 aa24.27■■□□□ 1.48
Snx16-201ENSMUST00000029047 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa24.26■■□□□ 1.47
Snx16-201ENSMUST00000029047 Il27Q8K3I6 234 aa24.26■■□□□ 1.47
Snx16-201ENSMUST00000029047 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa24.24■■□□□ 1.47
Snx16-201ENSMUST00000029047 Erich3F6QRE9 1637 aa24.23■■□□□ 1.47
Snx16-201ENSMUST00000029047 Ercc6F8VPZ5 1481 aa24.22■■□□□ 1.47
Snx16-201ENSMUST00000029047 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa24.21■■□□□ 1.47
Snx16-201ENSMUST00000029047 Grin2bQ01097 1482 aa24.18■■□□□ 1.46
Snx16-201ENSMUST00000029047 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa24.16■■□□□ 1.46
Snx16-201ENSMUST00000029047 Ankrd26Q811D2 1581 aa24.15■■□□□ 1.46
Snx16-201ENSMUST00000029047 Baz1bQ9Z277 1479 aa24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 182.5 ms