RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028972.8

Pdrg1-201, Transcript of p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdrg1, Length 1,273 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa37.71■■■■□ 3.63
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Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Abcc8B2RUS7 1588 aa36.01■■■■□ 3.35
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 ScribQ80U72 1612 aa34.61■■■■□ 3.13
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 NacadQ5SWP3 1504 aa33.6■■■□□ 2.97
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Kdm5dQ62240 1548 aa33.53■■■□□ 2.96
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Dcaf1Q80TR8 1506 aa33.19■■■□□ 2.9
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Sycp2Q9CUU3 1500 aa32.92■■■□□ 2.86
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa32.53■■■□□ 2.8
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Rhox8Q6VSS7 320 aa32.42■■■□□ 2.78
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 BicraF8VPZ9 1578 aa32.4■■■□□ 2.78
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Baz1aO88379 1555 aa32.09■■■□□ 2.73
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Ccdc180J3QNE4 1664 aa32.08■■■□□ 2.73
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Crybg2B7ZCC2 1516 aa31.94■■■□□ 2.7
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Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
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Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Ercc6F8VPZ5 1481 aa30.91■■■□□ 2.54
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Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Rtl1Q7M732 1744 aa30.78■■■□□ 2.52
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa30.69■■■□□ 2.5
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Wdr62Q3U3T8 1523 aa30.57■■■□□ 2.49
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Fam135aQ6NS59 1506 aa30.52■■■□□ 2.48
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Frmpd1A2AKB4 1549 aa30.51■■■□□ 2.47
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Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa30.29■■■□□ 2.44
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa30.27■■■□□ 2.44
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Synj1Q8CHC4 1574 aa30.27■■■□□ 2.44
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Baz1bQ9Z277 1479 aa30.22■■■□□ 2.43
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Unc13aQ4KUS2 1712 aa30.06■■■□□ 2.4
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Ubl4bQ9CQ84 188 aa30.06■■■□□ 2.4
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Trim41Q5NCC3 630 aa29.86■■■□□ 2.37
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Mrc2Q64449 1479 aa29.83■■■□□ 2.37
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Kif15Q6P9L6 1387 aa29.51■■■□□ 2.31
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Cux2P70298 1426 aa29.45■■■□□ 2.3
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Lamc3Q9R0B6 1581 aa29.41■■■□□ 2.3
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Golga3P55937 1487 aa29.29■■■□□ 2.28
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Top2bQ64511 1612 aa29.2■■■□□ 2.27
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Cngb1E1AZ71 1325 aa29.19■■■□□ 2.26
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Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Kif21aQ9QXL2 1672 aa29.17■■■□□ 2.26
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Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Ccdc18Q640L5 1455 aa29.02■■■□□ 2.24
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Fmn1Q05860 1466 aa28.94■■■□□ 2.22
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Il27Q8K3I6 234 aa28.92■■■□□ 2.22
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Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Crocc2F6XLV1 1638 aa28.71■■■□□ 2.19
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Plb1Q3TTY0 1478 aa28.71■■■□□ 2.19
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Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Grin2bQ01097 1482 aa28.53■■■□□ 2.16
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Duox2A2AQ99 1517 aa28.51■■■□□ 2.15
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa28.5■■■□□ 2.15
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Ift140E9PY46 1464 aa28.49■■■□□ 2.15
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Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Rusc2Q80U22 1514 aa28.34■■■□□ 2.13
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Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Chic1Q8CBW7 227 aa28.3■■■□□ 2.12
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Samd9lQ69Z37 1561 aa28.28■■■□□ 2.12
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Pdrg1-201ENSMUST00000028972 HrcG5E8J6 738 aa27.89■■■□□ 2.06
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Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Col17a1Q07563 1470 aa27.85■■■□□ 2.05
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