RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028398.13

Ube2e3-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2e3, Length 2,249 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 NischQ80TM9 1593 aa41.9■■■■■ 4.3
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa41.23■■■■■ 4.19
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Abcc9P70170 1546 aa40.79■■■■■ 4.12
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Abcc8B2RUS7 1588 aa39.75■■■■□ 3.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rtl1Q7M732 1744 aa39.02■■■■□ 3.84
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rhox8Q6VSS7 320 aa38.83■■■■□ 3.81
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc180J3QNE4 1664 aa38.27■■■■□ 3.72
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP37.45■■■■□ 3.59
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dcaf1Q80TR8 1506 aa37.24■■■■□ 3.55
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 ScribQ80U72 1612 aa36.93■■■■□ 3.5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa36.75■■■■□ 3.47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa36.62■■■■□ 3.45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Baz1aO88379 1555 aa36.37■■■■□ 3.41
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 HrcG5E8J6 738 aa36.32■■■■□ 3.4
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kdm5dQ62240 1548 aa36.28■■■■□ 3.4
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa35.97■■■■□ 3.35
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 NacadQ5SWP3 1504 aa35.94■■■■□ 3.34
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Crybg2B7ZCC2 1516 aa35.67■■■■□ 3.3
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Smarca2Q6DIC0 1577 aa35.6■■■■□ 3.29
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Trim41Q5NCC3 630 aa35.38■■■■□ 3.26
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cep164Q5DU05 1446 aa35.19■■■■□ 3.22
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sycp2Q9CUU3 1500 aa35.15■■■■□ 3.22
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa34.53■■■■□ 3.12
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pcgf6Q99NA9 353 aa34.45■■■■□ 3.1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Golga3P55937 1487 aa34.43■■■■□ 3.1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Chic1Q8CBW7 227 aa34.42■■■■□ 3.1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cngb1E1AZ71 1325 aa34.4■■■■□ 3.1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Synj1Q8CHC4 1574 aa34.38■■■■□ 3.09
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 BicraF8VPZ9 1578 aa34.34■■■■□ 3.09
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa34.31■■■■□ 3.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 CftrP26361 1476 aa34.12■■■■□ 3.05
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gab3Q8BSM5 595 aa34.1■■■■□ 3.05
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Top2bQ64511 1612 aa34.1■■■■□ 3.05
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa34■■■■□ 3.03
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa33.7■■■□□ 2.99
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 NefmP08553 848 aa33.68■■■□□ 2.98
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mier1Q5UAK0 511 aa33.6■■■□□ 2.97
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa33.51■■■□□ 2.96
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fmn1Q05860 1466 aa33.48■■■□□ 2.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP33.43■■■□□ 2.94
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zeb1Q64318 1117 aa33.32■■■□□ 2.92
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa33.2■■■□□ 2.91
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cep162Q6ZQ06 1403 aa33.17■■■□□ 2.9
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP33.01■■■□□ 2.87
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Neurod1Q60867 357 aa33■■■□□ 2.87
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sall2Q9QX96 1004 aa32.98■■■□□ 2.87
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 UbtfP25976 765 aaKnown RBP32.97■■■□□ 2.87
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP32.93■■■□□ 2.86
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 TnnQ80Z71 1560 aa32.91■■■□□ 2.86
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Myt1lP97500 1187 aa32.79■■■□□ 2.84
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Npm2Q80W85 207 aa32.7■■■□□ 2.83
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP32.69■■■□□ 2.82
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP32.68■■■□□ 2.82
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Clip1Q922J3 1391 aa32.67■■■□□ 2.82
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Arhgap35Q91YM2 1499 aa32.56■■■□□ 2.8
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa32.54■■■□□ 2.8
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP32.54■■■□□ 2.8
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 NrkQ9R0G8 1455 aa32.52■■■□□ 2.8
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lamc3Q9R0B6 1581 aa32.5■■■□□ 2.79
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Wdr62Q3U3T8 1523 aa32.5■■■□□ 2.79
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Frmpd1A2AKB4 1549 aa32.49■■■□□ 2.79
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Wdr66E9Q743 1299 aa32.46■■■□□ 2.79
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 ClspnQ80YR7 1315 aa32.46■■■□□ 2.79
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa32.43■■■□□ 2.78
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PtprkP35822 1457 aa32.42■■■□□ 2.78
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Anks4bQ8K3X6 423 aa32.42■■■□□ 2.78
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 TonslQ6NZL6 1363 aa32.37■■■□□ 2.77
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Arap1Q4LDD4 1452 aa32.34■■■□□ 2.77
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Eea1Q8BL66 1411 aa32.32■■■□□ 2.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Shroom4Q1W617 1475 aa32.31■■■□□ 2.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Map3k1P53349 1493 aa32.3■■■□□ 2.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa32.27■■■□□ 2.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Camsap1A2AHC3 1581 aa32.26■■■□□ 2.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Unc13aQ4KUS2 1712 aa32.26■■■□□ 2.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc18Q640L5 1455 aa32.25■■■□□ 2.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kif15Q6P9L6 1387 aa32.18■■■□□ 2.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kdm5bQ80Y84 1544 aa32.16■■■□□ 2.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ercc6F8VPZ5 1481 aa32.11■■■□□ 2.73
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Setd5Q5XJV7 1441 aa32.1■■■□□ 2.73
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tiam1Q60610 1591 aa32.07■■■□□ 2.72
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Erich3F6QRE9 1637 aa32.06■■■□□ 2.72
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Grin2bQ01097 1482 aa32.04■■■□□ 2.72
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa32.02■■■□□ 2.72
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Il27Q8K3I6 234 aa32■■■□□ 2.71
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa32■■■□□ 2.71
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ankrd26Q811D2 1581 aa31.95■■■□□ 2.7
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa31.91■■■□□ 2.7
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa31.91■■■□□ 2.7
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Naip1Q9QWK5 1403 aa31.88■■■□□ 2.69
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Csrnp3P59055 597 aa31.86■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.9 ms