RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027792.5

Srp9-201, Transcript of Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Srp9, Length 1,367 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9-201ENSMUST00000027792 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa56.23■■■■■ 6.59
Srp9-201ENSMUST00000027792 NischQ80TM9 1593 aa55.53■■■■■ 6.48
Srp9-201ENSMUST00000027792 Abcc9P70170 1546 aa53.78■■■■■ 6.2
Srp9-201ENSMUST00000027792 Abcc8B2RUS7 1588 aa53.63■■■■■ 6.18
Srp9-201ENSMUST00000027792 ScribQ80U72 1612 aa51.56■■■■■ 5.84
Srp9-201ENSMUST00000027792 NacadQ5SWP3 1504 aa50■■■■■ 5.6
Srp9-201ENSMUST00000027792 Kdm5dQ62240 1548 aa49.92■■■■■ 5.58
Srp9-201ENSMUST00000027792 Dcaf1Q80TR8 1506 aa49.47■■■■■ 5.51
Srp9-201ENSMUST00000027792 Sycp2Q9CUU3 1500 aa49■■■■■ 5.43
Srp9-201ENSMUST00000027792 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa48.42■■■■■ 5.34
Srp9-201ENSMUST00000027792 BicraF8VPZ9 1578 aa48.26■■■■■ 5.32
Srp9-201ENSMUST00000027792 Rhox8Q6VSS7 320 aa48.13■■■■■ 5.3
Srp9-201ENSMUST00000027792 Ccdc180J3QNE4 1664 aa47.86■■■■■ 5.25
Srp9-201ENSMUST00000027792 Baz1aO88379 1555 aa47.77■■■■■ 5.24
Srp9-201ENSMUST00000027792 Crybg2B7ZCC2 1516 aa47.59■■■■■ 5.21
Srp9-201ENSMUST00000027792 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP46.99■■■■■ 5.11
Srp9-201ENSMUST00000027792 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP46.9■■■■■ 5.1
Srp9-201ENSMUST00000027792 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP46.5■■■■■ 5.03
Srp9-201ENSMUST00000027792 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa46.48■■■■■ 5.03
Srp9-201ENSMUST00000027792 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP46.41■■■■■ 5.02
Srp9-201ENSMUST00000027792 Smarca2Q6DIC0 1577 aa46.4■■■■■ 5.02
Srp9-201ENSMUST00000027792 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP46.21■■■■■ 4.99
Srp9-201ENSMUST00000027792 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa46.1■■■■■ 4.97
Srp9-201ENSMUST00000027792 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa45.92■■■■■ 4.94
Srp9-201ENSMUST00000027792 Ercc6F8VPZ5 1481 aa45.92■■■■■ 4.94
Srp9-201ENSMUST00000027792 Rtl1Q7M732 1744 aa45.91■■■■■ 4.94
Srp9-201ENSMUST00000027792 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa45.67■■■■■ 4.9
Srp9-201ENSMUST00000027792 Wdr62Q3U3T8 1523 aa45.5■■■■■ 4.87
Srp9-201ENSMUST00000027792 Fam135aQ6NS59 1506 aa45.42■■■■■ 4.86
Srp9-201ENSMUST00000027792 Frmpd1A2AKB4 1549 aa45.41■■■■■ 4.86
Srp9-201ENSMUST00000027792 CftrP26361 1476 aa45.13■■■■■ 4.82
Srp9-201ENSMUST00000027792 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP45.12■■■■■ 4.81
Srp9-201ENSMUST00000027792 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa45.12■■■■■ 4.81
Srp9-201ENSMUST00000027792 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP45.11■■■■■ 4.81
Srp9-201ENSMUST00000027792 Synj1Q8CHC4 1574 aa45.06■■■■■ 4.8
Srp9-201ENSMUST00000027792 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa45■■■■■ 4.79
Srp9-201ENSMUST00000027792 Baz1bQ9Z277 1479 aa44.98■■■■■ 4.79
Srp9-201ENSMUST00000027792 Unc13aQ4KUS2 1712 aa44.83■■■■■ 4.77
Srp9-201ENSMUST00000027792 Ubl4bQ9CQ84 188 aa44.66■■■■■ 4.74
Srp9-201ENSMUST00000027792 Trim41Q5NCC3 630 aa44.4■■■■■ 4.7
Srp9-201ENSMUST00000027792 Mrc2Q64449 1479 aa44.35■■■■■ 4.69
Srp9-201ENSMUST00000027792 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP44.31■■■■■ 4.68
Srp9-201ENSMUST00000027792 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP44■■■■■ 4.63
Srp9-201ENSMUST00000027792 Kif15Q6P9L6 1387 aa43.86■■■■■ 4.61
Srp9-201ENSMUST00000027792 Lamc3Q9R0B6 1581 aa43.79■■■■■ 4.6
Srp9-201ENSMUST00000027792 Cux2P70298 1426 aa43.79■■■■■ 4.6
Srp9-201ENSMUST00000027792 Golga3P55937 1487 aa43.59■■■■■ 4.57
Srp9-201ENSMUST00000027792 Top2bQ64511 1612 aa43.54■■■■■ 4.56
Srp9-201ENSMUST00000027792 Kif21aQ9QXL2 1672 aa43.41■■■■■ 4.54
Srp9-201ENSMUST00000027792 TnnQ80Z71 1560 aa43.38■■■■■ 4.53
Srp9-201ENSMUST00000027792 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa43.37■■■■■ 4.53
Srp9-201ENSMUST00000027792 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP43.34■■■■■ 4.53
Srp9-201ENSMUST00000027792 Cngb1E1AZ71 1325 aa43.34■■■■■ 4.53
Srp9-201ENSMUST00000027792 Cep164Q5DU05 1446 aa43.24■■■■■ 4.51
Srp9-201ENSMUST00000027792 Ccdc18Q640L5 1455 aa43.15■■■■■ 4.5
Srp9-201ENSMUST00000027792 Fmn1Q05860 1466 aa43.07■■■■■ 4.49
Srp9-201ENSMUST00000027792 Camsap1A2AHC3 1581 aa43.02■■■■■ 4.48
Srp9-201ENSMUST00000027792 Il27Q8K3I6 234 aa42.93■■■■■ 4.46
Srp9-201ENSMUST00000027792 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP42.88■■■■■ 4.45
Srp9-201ENSMUST00000027792 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP42.86■■■■■ 4.45
Srp9-201ENSMUST00000027792 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP42.78■■■■■ 4.44
Srp9-201ENSMUST00000027792 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP42.74■■■■■ 4.43
Srp9-201ENSMUST00000027792 Crocc2F6XLV1 1638 aa42.71■■■■■ 4.43
Srp9-201ENSMUST00000027792 Plb1Q3TTY0 1478 aa42.68■■■■■ 4.42
Srp9-201ENSMUST00000027792 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP42.64■■■■■ 4.42
Srp9-201ENSMUST00000027792 Grin2bQ01097 1482 aa42.45■■■■■ 4.39
Srp9-201ENSMUST00000027792 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa42.43■■■■■ 4.38
Srp9-201ENSMUST00000027792 Duox2A2AQ99 1517 aa42.43■■■■■ 4.38
Srp9-201ENSMUST00000027792 Ift140E9PY46 1464 aa42.37■■■■■ 4.37
Srp9-201ENSMUST00000027792 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
Srp9-201ENSMUST00000027792 Efcab5A0JP43 1406 aa42.18■■■■■ 4.34
Srp9-201ENSMUST00000027792 Rusc2Q80U22 1514 aa42.16■■■■■ 4.34
Srp9-201ENSMUST00000027792 Chic1Q8CBW7 227 aa42.12■■■■■ 4.33
Srp9-201ENSMUST00000027792 Samd9lQ69Z37 1561 aa42.1■■■■■ 4.33
Srp9-201ENSMUST00000027792 Shroom2A2ALU4 1481 aa42.1■■■■■ 4.33
Srp9-201ENSMUST00000027792 Disp1Q3TDN0 1521 aa42.08■■■■■ 4.33
Srp9-201ENSMUST00000027792 NrkQ9R0G8 1455 aa42.06■■■■■ 4.32
Srp9-201ENSMUST00000027792 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP41.99■■■■■ 4.31
Srp9-201ENSMUST00000027792 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP41.91■■■■■ 4.3
Srp9-201ENSMUST00000027792 Dnajc5P60904 198 aa41.89■■■■■ 4.3
Srp9-201ENSMUST00000027792 Setd1bQ8CFT2 1985 aa41.87■■■■■ 4.29
Srp9-201ENSMUST00000027792 Shroom4Q1W617 1475 aa41.86■■■■■ 4.29
Srp9-201ENSMUST00000027792 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa41.84■■■■■ 4.29
Srp9-201ENSMUST00000027792 PtprkP35822 1457 aa41.78■■■■■ 4.28
Srp9-201ENSMUST00000027792 Rad54l2Q99NG0 1466 aa41.78■■■■■ 4.28
Srp9-201ENSMUST00000027792 Grin2aP35436 1464 aa41.7■■■■■ 4.27
Srp9-201ENSMUST00000027792 Magi3Q9EQJ9 1476 aa41.7■■■■■ 4.27
Srp9-201ENSMUST00000027792 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.26
Srp9-201ENSMUST00000027792 SynmQ70IV5 1561 aa41.59■■■■■ 4.25
Srp9-201ENSMUST00000027792 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
Srp9-201ENSMUST00000027792 HrcG5E8J6 738 aa41.54■■■■■ 4.24
Srp9-201ENSMUST00000027792 Gpatch8A2A6A1 1505 aa41.53■■■■■ 4.24
Srp9-201ENSMUST00000027792 Pla2r1Q62028 1487 aa41.48■■■■■ 4.23
Srp9-201ENSMUST00000027792 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP41.43■■■■■ 4.22
Srp9-201ENSMUST00000027792 Col17a1Q07563 1470 aa41.42■■■■■ 4.22
Srp9-201ENSMUST00000027792 Zeb1Q64318 1117 aa41.4■■■■■ 4.22
Srp9-201ENSMUST00000027792 Fgd6Q69ZL1 1399 aa41.33■■■■■ 4.21
Srp9-201ENSMUST00000027792 Npm2Q80W85 207 aa41.33■■■■■ 4.21
Srp9-201ENSMUST00000027792 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa41.31■■■■■ 4.2
Srp9-201ENSMUST00000027792 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16 ms