RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025823.4

Rce1-201, Transcript of CAAX prenyl protease 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rce1, Length 1,402 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rce1-201ENSMUST00000025823 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa43.98■■■■■ 4.63
Rce1-201ENSMUST00000025823 NischQ80TM9 1593 aa43.53■■■■■ 4.56
Rce1-201ENSMUST00000025823 Abcc9P70170 1546 aa42.14■■■■■ 4.34
Rce1-201ENSMUST00000025823 Abcc8B2RUS7 1588 aa42.02■■■■■ 4.32
Rce1-201ENSMUST00000025823 ScribQ80U72 1612 aa40.32■■■■■ 4.04
Rce1-201ENSMUST00000025823 NacadQ5SWP3 1504 aa39.19■■■■□ 3.86
Rce1-201ENSMUST00000025823 Kdm5dQ62240 1548 aa39.08■■■■□ 3.85
Rce1-201ENSMUST00000025823 Dcaf1Q80TR8 1506 aa38.81■■■■□ 3.8
Rce1-201ENSMUST00000025823 Sycp2Q9CUU3 1500 aa38.39■■■■□ 3.74
Rce1-201ENSMUST00000025823 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa37.94■■■■□ 3.66
Rce1-201ENSMUST00000025823 Rhox8Q6VSS7 320 aa37.85■■■■□ 3.65
Rce1-201ENSMUST00000025823 BicraF8VPZ9 1578 aa37.77■■■■□ 3.64
Rce1-201ENSMUST00000025823 Ccdc180J3QNE4 1664 aa37.49■■■■□ 3.59
Rce1-201ENSMUST00000025823 Baz1aO88379 1555 aa37.45■■■■□ 3.59
Rce1-201ENSMUST00000025823 Crybg2B7ZCC2 1516 aa37.37■■■■□ 3.57
Rce1-201ENSMUST00000025823 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
Rce1-201ENSMUST00000025823 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
Rce1-201ENSMUST00000025823 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
Rce1-201ENSMUST00000025823 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa36.37■■■■□ 3.41
Rce1-201ENSMUST00000025823 Smarca2Q6DIC0 1577 aa36.36■■■■□ 3.41
Rce1-201ENSMUST00000025823 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
Rce1-201ENSMUST00000025823 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.38
Rce1-201ENSMUST00000025823 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa36.13■■■■□ 3.37
Rce1-201ENSMUST00000025823 Ercc6F8VPZ5 1481 aa35.97■■■■□ 3.35
Rce1-201ENSMUST00000025823 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa35.96■■■■□ 3.35
Rce1-201ENSMUST00000025823 Rtl1Q7M732 1744 aa35.94■■■■□ 3.34
Rce1-201ENSMUST00000025823 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa35.71■■■■□ 3.31
Rce1-201ENSMUST00000025823 Wdr62Q3U3T8 1523 aa35.62■■■■□ 3.29
Rce1-201ENSMUST00000025823 Frmpd1A2AKB4 1549 aa35.58■■■■□ 3.29
Rce1-201ENSMUST00000025823 Fam135aQ6NS59 1506 aa35.54■■■■□ 3.28
Rce1-201ENSMUST00000025823 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
Rce1-201ENSMUST00000025823 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
Rce1-201ENSMUST00000025823 CftrP26361 1476 aa35.4■■■■□ 3.26
Rce1-201ENSMUST00000025823 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa35.38■■■■□ 3.25
Rce1-201ENSMUST00000025823 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa35.33■■■■□ 3.25
Rce1-201ENSMUST00000025823 Synj1Q8CHC4 1574 aa35.3■■■■□ 3.24
Rce1-201ENSMUST00000025823 Baz1bQ9Z277 1479 aa35.27■■■■□ 3.24
Rce1-201ENSMUST00000025823 Ubl4bQ9CQ84 188 aa35.06■■■■□ 3.2
Rce1-201ENSMUST00000025823 Unc13aQ4KUS2 1712 aa35■■■■□ 3.19
Rce1-201ENSMUST00000025823 Trim41Q5NCC3 630 aa34.96■■■■□ 3.19
Rce1-201ENSMUST00000025823 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
Rce1-201ENSMUST00000025823 Mrc2Q64449 1479 aa34.73■■■■□ 3.15
Rce1-201ENSMUST00000025823 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
Rce1-201ENSMUST00000025823 Kif15Q6P9L6 1387 aa34.41■■■■□ 3.1
Rce1-201ENSMUST00000025823 Cux2P70298 1426 aa34.33■■■■□ 3.09
Rce1-201ENSMUST00000025823 Lamc3Q9R0B6 1581 aa34.32■■■■□ 3.08
Rce1-201ENSMUST00000025823 Golga3P55937 1487 aa34.22■■■■□ 3.07
Rce1-201ENSMUST00000025823 Top2bQ64511 1612 aa34.11■■■■□ 3.05
Rce1-201ENSMUST00000025823 Cngb1E1AZ71 1325 aa34.06■■■■□ 3.04
Rce1-201ENSMUST00000025823 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
Rce1-201ENSMUST00000025823 TnnQ80Z71 1560 aa33.98■■■■□ 3.03
Rce1-201ENSMUST00000025823 Kif21aQ9QXL2 1672 aa33.94■■■■□ 3.02
Rce1-201ENSMUST00000025823 Cep164Q5DU05 1446 aa33.94■■■■□ 3.02
Rce1-201ENSMUST00000025823 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa33.89■■■■□ 3.02
Rce1-201ENSMUST00000025823 Ccdc18Q640L5 1455 aa33.85■■■■□ 3.01
Rce1-201ENSMUST00000025823 Fmn1Q05860 1466 aa33.81■■■■□ 3
Rce1-201ENSMUST00000025823 Il27Q8K3I6 234 aa33.71■■■□□ 2.99
Rce1-201ENSMUST00000025823 Camsap1A2AHC3 1581 aa33.7■■■□□ 2.99
Rce1-201ENSMUST00000025823 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP33.64■■■□□ 2.98
Rce1-201ENSMUST00000025823 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP33.63■■■□□ 2.97
Rce1-201ENSMUST00000025823 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP33.48■■■□□ 2.95
Rce1-201ENSMUST00000025823 Plb1Q3TTY0 1478 aa33.45■■■□□ 2.95
Rce1-201ENSMUST00000025823 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP33.45■■■□□ 2.94
Rce1-201ENSMUST00000025823 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP33.44■■■□□ 2.94
Rce1-201ENSMUST00000025823 Crocc2F6XLV1 1638 aa33.44■■■□□ 2.94
Rce1-201ENSMUST00000025823 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa33.3■■■□□ 2.92
Rce1-201ENSMUST00000025823 Grin2bQ01097 1482 aa33.3■■■□□ 2.92
Rce1-201ENSMUST00000025823 Duox2A2AQ99 1517 aa33.28■■■□□ 2.92
Rce1-201ENSMUST00000025823 Ift140E9PY46 1464 aa33.23■■■□□ 2.91
Rce1-201ENSMUST00000025823 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP33.16■■■□□ 2.9
Rce1-201ENSMUST00000025823 Efcab5A0JP43 1406 aa33.13■■■□□ 2.89
Rce1-201ENSMUST00000025823 Chic1Q8CBW7 227 aa33.11■■■□□ 2.89
Rce1-201ENSMUST00000025823 NrkQ9R0G8 1455 aa33.02■■■□□ 2.88
Rce1-201ENSMUST00000025823 Rusc2Q80U22 1514 aa33■■■□□ 2.87
Rce1-201ENSMUST00000025823 Disp1Q3TDN0 1521 aa32.99■■■□□ 2.87
Rce1-201ENSMUST00000025823 Samd9lQ69Z37 1561 aa32.96■■■□□ 2.87
Rce1-201ENSMUST00000025823 Shroom2A2ALU4 1481 aa32.95■■■□□ 2.86
Rce1-201ENSMUST00000025823 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP32.86■■■□□ 2.85
Rce1-201ENSMUST00000025823 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP32.85■■■□□ 2.85
Rce1-201ENSMUST00000025823 Shroom4Q1W617 1475 aa32.85■■■□□ 2.85
Rce1-201ENSMUST00000025823 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa32.83■■■□□ 2.85
Rce1-201ENSMUST00000025823 Dnajc5P60904 198 aa32.78■■■□□ 2.84
Rce1-201ENSMUST00000025823 HrcG5E8J6 738 aa32.77■■■□□ 2.84
Rce1-201ENSMUST00000025823 PtprkP35822 1457 aa32.77■■■□□ 2.84
Rce1-201ENSMUST00000025823 Rad54l2Q99NG0 1466 aa32.75■■■□□ 2.83
Rce1-201ENSMUST00000025823 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.83
Rce1-201ENSMUST00000025823 Setd1bQ8CFT2 1985 aa32.7■■■□□ 2.83
Rce1-201ENSMUST00000025823 Grin2aP35436 1464 aa32.68■■■□□ 2.82
Rce1-201ENSMUST00000025823 Magi3Q9EQJ9 1476 aa32.68■■■□□ 2.82
Rce1-201ENSMUST00000025823 SynmQ70IV5 1561 aa32.59■■■□□ 2.81
Rce1-201ENSMUST00000025823 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP32.58■■■□□ 2.81
Rce1-201ENSMUST00000025823 Zeb1Q64318 1117 aa32.53■■■□□ 2.8
Rce1-201ENSMUST00000025823 Gpatch8A2A6A1 1505 aa32.51■■■□□ 2.79
Rce1-201ENSMUST00000025823 Pla2r1Q62028 1487 aa32.51■■■□□ 2.79
Rce1-201ENSMUST00000025823 Npm2Q80W85 207 aa32.5■■■□□ 2.79
Rce1-201ENSMUST00000025823 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
Rce1-201ENSMUST00000025823 Fgd6Q69ZL1 1399 aa32.43■■■□□ 2.78
Rce1-201ENSMUST00000025823 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa32.43■■■□□ 2.78
Rce1-201ENSMUST00000025823 Col17a1Q07563 1470 aa32.41■■■□□ 2.78
Rce1-201ENSMUST00000025823 Gab3Q8BSM5 595 aa32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9.5 ms