RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021666.5

Abcd4-201, Transcript of ATP-binding cassette sub-family D member 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Abcd4, Length 2,309 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd4-201ENSMUST00000021666 NischQ80TM9 1593 aa32.57■■■□□ 2.8
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa32.07■■■□□ 2.72
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Abcc9P70170 1546 aa31.64■■■□□ 2.66
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Abcc8B2RUS7 1588 aa30.96■■■□□ 2.55
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Rhox8Q6VSS7 320 aa30.01■■■□□ 2.4
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Rtl1Q7M732 1744 aa29.7■■■□□ 2.34
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Ccdc180J3QNE4 1664 aa29.14■■■□□ 2.26
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Dcaf1Q80TR8 1506 aa28.97■■■□□ 2.23
Abcd4-201ENSMUST00000021666 ScribQ80U72 1612 aa28.82■■■□□ 2.2
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa28.5■■■□□ 2.15
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Kdm5dQ62240 1548 aa28.3■■■□□ 2.12
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Baz1aO88379 1555 aa28.21■■■□□ 2.11
Abcd4-201ENSMUST00000021666 NacadQ5SWP3 1504 aa28.13■■■□□ 2.09
Abcd4-201ENSMUST00000021666 HrcG5E8J6 738 aa27.86■■■□□ 2.05
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa27.86■■■□□ 2.05
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Crybg2B7ZCC2 1516 aa27.83■■■□□ 2.04
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Smarca2Q6DIC0 1577 aa27.58■■■□□ 2.01
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Sycp2Q9CUU3 1500 aa27.5■■□□□ 1.99
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa27.45■■□□□ 1.98
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Trim41Q5NCC3 630 aa27.4■■□□□ 1.98
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Cep164Q5DU05 1446 aa27■■□□□ 1.91
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa26.88■■□□□ 1.89
Abcd4-201ENSMUST00000021666 BicraF8VPZ9 1578 aa26.87■■□□□ 1.89
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Synj1Q8CHC4 1574 aa26.64■■□□□ 1.86
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Golga3P55937 1487 aa26.63■■□□□ 1.85
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Cngb1E1AZ71 1325 aa26.62■■□□□ 1.85
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Chic1Q8CBW7 227 aa26.57■■□□□ 1.84
Abcd4-201ENSMUST00000021666 CftrP26361 1476 aa26.55■■□□□ 1.84
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa26.46■■□□□ 1.83
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa26.37■■□□□ 1.81
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Top2bQ64511 1612 aa26.33■■□□□ 1.81
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Gab3Q8BSM5 595 aa26.26■■□□□ 1.79
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa25.98■■□□□ 1.75
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Fmn1Q05860 1466 aa25.94■■□□□ 1.74
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa25.92■■□□□ 1.74
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa25.81■■□□□ 1.72
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Pcgf6Q99NA9 353 aa25.8■■□□□ 1.72
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Mier1Q5UAK0 511 aa25.6■■□□□ 1.69
Abcd4-201ENSMUST00000021666 NefmP08553 848 aa25.6■■□□□ 1.69
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Cep162Q6ZQ06 1403 aa25.59■■□□□ 1.69
Abcd4-201ENSMUST00000021666 TnnQ80Z71 1560 aa25.51■■□□□ 1.67
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Frmpd1A2AKB4 1549 aa25.44■■□□□ 1.66
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Wdr62Q3U3T8 1523 aa25.42■■□□□ 1.66
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Npm2Q80W85 207 aa25.35■■□□□ 1.65
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Myt1lP97500 1187 aa25.34■■□□□ 1.65
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Lamc3Q9R0B6 1581 aa25.3■■□□□ 1.64
Abcd4-201ENSMUST00000021666 UbtfP25976 765 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Zeb1Q64318 1117 aa25.21■■□□□ 1.63
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Ercc6F8VPZ5 1481 aa25.19■■□□□ 1.62
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Clip1Q922J3 1391 aa25.18■■□□□ 1.62
Abcd4-201ENSMUST00000021666 NrkQ9R0G8 1455 aa25.18■■□□□ 1.62
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Arhgap35Q91YM2 1499 aa25.16■■□□□ 1.62
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Kif15Q6P9L6 1387 aa25.15■■□□□ 1.62
Abcd4-201ENSMUST00000021666 PtprkP35822 1457 aa25.14■■□□□ 1.61
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Unc13aQ4KUS2 1712 aa25.1■■□□□ 1.61
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Camsap1A2AHC3 1581 aa25.06■■□□□ 1.6
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Shroom4Q1W617 1475 aa25.04■■□□□ 1.6
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Map3k1P53349 1493 aa24.98■■□□□ 1.59
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Il27Q8K3I6 234 aa24.98■■□□□ 1.59
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Eea1Q8BL66 1411 aa24.97■■□□□ 1.59
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa24.95■■□□□ 1.59
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Ccdc18Q640L5 1455 aa24.95■■□□□ 1.59
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Grin2bQ01097 1482 aa24.92■■□□□ 1.58
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Arap1Q4LDD4 1452 aa24.89■■□□□ 1.58
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Sall2Q9QX96 1004 aa24.89■■□□□ 1.57
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa24.88■■□□□ 1.57
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa24.83■■□□□ 1.57
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa24.82■■□□□ 1.56
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Setd5Q5XJV7 1441 aa24.82■■□□□ 1.56
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Cux2P70298 1426 aa24.73■■□□□ 1.55
Abcd4-201ENSMUST00000021666 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Baz1bQ9Z277 1479 aa24.71■■□□□ 1.55
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Efcab5A0JP43 1406 aa24.68■■□□□ 1.54
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Ubl4bQ9CQ84 188 aa24.67■■□□□ 1.54
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
Abcd4-201ENSMUST00000021666 TonslQ6NZL6 1363 aa24.67■■□□□ 1.54
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Erich3F6QRE9 1637 aa24.66■■□□□ 1.54
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Tiam1Q60610 1591 aa24.66■■□□□ 1.54
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Neurod1Q60867 357 aa24.65■■□□□ 1.54
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa24.64■■□□□ 1.54
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Ankrd26Q811D2 1581 aa24.62■■□□□ 1.53
Abcd4-201ENSMUST00000021666 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Naip1Q9QWK5 1403 aa24.6■■□□□ 1.53
Abcd4-201ENSMUST00000021666 Wdr66E9Q743 1299 aa24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.7 ms